CBAS – Hệ thống Phân tích Tin sinh học toàn diện (Comprehensive bioinformatics analysis system)

Mặc dù các công cụ phân tích Tin sinh học được công bố rất đa dạng và theo bản quyền nghiên cứu miễn phí (Academic Free License), nhưng các công cụ được nhiều nhóm khác nhau phát triển trên các ngôn ngữ lập trình khác nhau như Java, Python, R,...

Dịch vụ phân tích Tin sinh học theo dự án

Dịch vụ phân tích Tin sinh học theo dự án Càng ngày, phân tích Tin sinh học càng là một nút thắt trong quá trình nghiên cứu. Do việc đọc trình tự thế hệ mới có chi phí giải ngày càng rẻ và tốc độ cùng chất lượng ngày càng...

Máy bán DNA tự động

Máy bán hàng tự động bán nước ngọt, kẹo và khoai tây chiên đã không còn gì xa lạ với chúng ta. Nhưng đối với Fellow Gabe Barcia-Colombo thì khác, nghệ sĩ này đã tưởng tượng ra một máy bán DNA tự động, DNA được tách chiết từ con người,...

SortMeRNA: Công cụ phát hiện rRNA trong dữ liệu transcriptome RNA-seq

Mục tiêu: Việc áp dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS) vào các dự án RNA-seq đã đặt ra một bài toán khó giải cho các nhóm nghiên cứu rằng: tách chiết RNA tổng số có bị lẫn ribosomal RNA (rRNA) hay không? Sàng lọc được coding...

Tổng quan về chú giải chức năng cho dữ liệu RNA-seq

Tính ứng dụng và tiện lợi từ việc tạo ra dữ liệu RNA-seq đã thúc đẩy những hướng nghiên cứu về chú giải chức năng trong những năm gần đây. Mặc dù vậy, những phân tích về RNA-seq mới chỉ đưa ra một danh sách gen riêng biệt (differentially expressed...

Giới thiệu về GATK (Genome Analysis Toolkit) – công cụ tìm kiếm SNPs trong giải trình tự gene thế hệ mới (NGS)

GATK là gì? Theo đúng tên gọi của nó, GATK là tập hợp các công cụ phân tích bộ genome. GATK sẽ cho phép bạn xác định tìm SNPs, InDels, xác định các đột biến hiếm gặp, cũng như những đột biến nào là đặc trưng cho một nhóm bệnh...

Nghiên cứu cho thấy gen tác động đến xu hướng tình dục ở nam giới

Một nghiên cứu trên những người đàn ông đồng tính ở Mỹ đã tìm thấy bằng chứng chứng minh rằng xu hướng tình dục của nam giới có bị tác động bởi gen. Các nhà khoa học đã lấy mẫu DNA của 400 người đàn ông đồng tính và thấy...

Sự tái bắt cặp những read không sắp xếp được dựa vào điểm chất lượng.

Tóm tăt Nguyên nhân: Dựa vào công nghệ giải trình tự thế hệ mới, một loạt những ứng dụng trong sinh học đã được phát triển, trong đó sự bắt cặp trình tự (alignment) là bước đầu khi thu được các read giải trình tự. Những năm gần đây, nhiều...

Mô hình hóa cấu trúc protein của gen và hệ gen

Phương pháp so sánh mô hình (Comparative modelling) là một phương pháp dự đoán cấu trúc ba chiều của một chuỗi amino acid (protein) dựa vào sự liên kết của nó với một hoặc một vài cấu trúc protein đã sẵn có.Quá trình dự đoán bao gồm xác định dạng...

Chân dung ba chiều được dựng từ DNA trong một dự án nghệ thuật

Năm 2013, một nghệ sĩ ở New York, cô Heather Dewey-Hagborg đã có một dự án rất thú vị có tên gọi “Hình dung của người xa lạ” (tên gốc “Stranger visions”). Là sự kết hợp giữa nghệ thuật và khoa học hình sự, Heather thực hiện tách DNA từ...