LB•BIA: Dịch vụ phân tích Tin sinh học toàn diện

  • Hơn 10 năm kinh nghiệm phân tích Tin sinh học
  • Hệ thống phân tích Tin sinh học tự động, toàn diện trên nền điện toán đám mây
  • Khả năng lưu trữ khổng lồ lên tới 100TB

Các dịch vụ chính của LB·BIA

  • Tư vấn, đào tạo phân tích Tin sinh học
  • Phân tích hệ gen: de novo assembly, variant calling (WGS, WES, Gene Panel)
  • Phân tích hệ phiên mã: RNA-seq Differentially expressed genes, de novo assembly
  • Phân tích Metagenomics (16S/Shotgun)
  • Phân tích SNP chip / microarray
  • Tư vấn và phân tích cho các dự án GWAS

LB•SEQ: Dịch vụ NGS Sequencing đa dạng

LOBI cung cấp dịch vụ tư vấn và NGS sequencing đa dạng, linh hoạt và nhanh chóng. 

  • Tư vấn kỹ thuật, phương án sequencing phù hợp với nhu cầu của đề tài, dự án
  • Short read sequencing: WGS, WES, RNA-Seq, Targeted sequencing, Metagenomics (shotgun, 16S V1-V9, 16S rRNA)
  • Long read sequencing: PacBio, Oxford nanopore
  • Single-Cell sequencing: 10X genomics, Dolomite, ..
  • Sanger Sequencing
  • Chất lượng đọc trình tự cao, Thời gian trả kết quả nhanh

LB•WES: Dịch vụ Giải trình tự và phân tích Exome

Phương pháp giải trình tự toàn bộ exome (Whole Exome Sequencing – WES) cho phép xác định các biến thể trong các vùng mã hóa protein của bất kỳ gen nào. Giải trình tự toàn bộ exome đã được ứng dụng rộng rãi cả trong nghiên cứu khoa học và chẩn đoán lâm sàng. Một số ưu điểm của WES:

  • Chấp nhận mẫu đa dạng (DNA, mẫu máu, mẫu mô FFPE, …)
  • WES và phân tích bởi phòng lab ở Mỹ có chứng chỉ CLIA/CAP
  • Tiết kiệm chi phí hơn rất nhiều so với phương pháp giải trình tự toàn bộ hệ gen (WGS).

LB•ARRAY: Dịch vụ microarray genotyping

Các loại SNP Array đa dạng, chính xác và nhanh chóng

đối tác của chúng tôi

FAQ

Tin sinh học là gì?

Tin sinh học (bioinformatics) là một lĩnh vực mới của khoa học mới của khoa học sự sống (life science). Một tiêu chính của tin sinh học là hiểu được những thông tin được chứa đựng trọng sinh vật sống. Tin sinh học là sự kết hợp của sinh học (biology), khoa học máy tính (computer science), và phân tích dữ liệu (data analysis). Tin sinh học cũng có thể hiểu là khoa học dữ liệu (data science) nghiên cứu thông tin được lưu trữ và xử lý trong cơ thể sống như thế nào.

de novo assembly là gì?

de novo assembly (còn có thể hiểu là de novo sequencing) là phương pháp xây dựng một hệ gen hoàn toàn mới từ rất nhiều đoạn trình tự ngắn (DNA fragments/short-reads) mà không có bất kỳ thông tin nào trước đó về hệ gen chiếu hoặc thứ tự của các đoạn trình tự.

Dự đoán gen là gì?

Dự đoán gen (gene prediction) hay còn gọi là tìm kiếm gene (gene finding) là quá trình xác địnd các đoạn trình tự DNA mà mã hóa cho gen. Những gen được dự đoán có thể là những gen mã hóa cho protein hoặc là các RNA. Đôi khi dự đoán gen còn bao gồm cả tìm kiếm các đoạn trình tự có chức năng khác như là các vùng điều hòa. Tìm kiếm hay dự doán gen là bước đầu tiên và là một trong những bước quan trọng để nghiên cứu về hệ gen của một loài sinh vật nào đó sau khi hệ gen của nó được de novo assembly.

Single nucleotide polymorphism (SNP) là gì?

Single nucleotide polymorphism (SNP) là khác biệt tại một vị trí đơn lẻ trong trình tự DNA giữa các cá thể. Nhắc lại là các đoạn trình tự DNA được hình thành từ 4 nucleotit khác nhau là A, T, G và C. Nếu sự sai khác này xảy ra ở hơn 1% quần thể thì điểm khác biệt đó được gọi là SNP. Nếu SNP xảy ra trong gen thì gen đó được mô ta là có hơn một allele. Trong nhiều trường hợp, SNPs có thể gây ra biến đổi các chuổi trình tự axit amin, tuy nhiên, SNP có thể xảy ở các vị trí ngoài gen.

Gióng hàng trình tự là gì?

Trong tin sinh học, gióng hàng trình tự (sequence alignment) là các sắp xếp các vùng trình tự (có thể là DNA, RNA, hoặc protein) để tìm ra những vùng trình tự tương đồng. Những vùng tương đồng đó giữa các trình tự có thể có liên quan tới một chức năng, cấu trúc hay một quá trình tiến hóa nào đó.