Giải trình tự thế hệ mới

Metagenomics: Phát Hiện Mầm Bệnh Của Mẫu Huyết Tương Từ Bệnh Nhân Bị Nhiễm Trùng Huyết ở Uganda

Trong bài viết này, chúng tôi tóm lược nội dung nghiên cứu được công bố năm 2023 bởi Grundy và cộng sự trên tạp chí Microbiology Spectrum (DOI). Bài báo này trình bày kết quả của một nghiên cứu được thực hiện tại Uganda, nhằm mục đích sử dụng giải...

Ứng dụng của Metagenomics trong nghiên cứu về đất

Metagenomics là gì? Metagenomics là nghiên cứu vật chất di truyền thu được trực tiếp từ các mẫu môi trường. Thay vì nuôi cấy các vi sinh vật riêng lẻ, metagenomics cho phép các nhà nghiên cứu nghiên cứu toàn bộ cộng đồng vi sinh vật trong môi trường sống...

Các bước cơ bản để tiến hành lắp ráp và chú giải hệ gene

Các bước cơ bản để tiến hành lắp ráp và chú giải hệ gene Hiện nay, với những tiến bộ trong công nghệ giải trình tự, quá trình lắp ráp và chú giải trình tự hệ gene của hầu hết các sinh vật, bao gồm cả hệ gene của sinh...

VGP – Vertebrate Genomes Projects

Dự án lắp ráp hệ gen động vật có xương sống Việc lắp ráp các hệ gen tham chiếu cung cấp một bản đồ trình tự của một loài sinh vật và “bối cảnh không gian” của nó – nghĩa là vị trí của một đoạn DNA cụ thể được...

Ứng dụng WGS cho định danh nấm trong y tế

Giải trình tự toàn hệ gene nấm cho công việc định danh loài: Từ phát triển xét nghiệm đến ứng dụng lâm sàng Các phương pháp giải trình tự gene thế hệ mới ra đời (NGS) đã giúp cho việc phát triển và đánh giá khả năng định danh loài...

Cơ sở dữ liệu Silva ribosomal RNA database

Giới thiệu về Silva ribosomal RNA database Cơ sở dữ liệu RNA ribosomal Silva là một nguồn tài nguyên quan trọng trong lĩnh vực sinh thái vi sinh vật và phân loại vi sinh vật. Nó cung cấp dữ liệu chuỗi RNA ribosomal được thu thập từ các hệ vi...

Pan-genomics là gì?

Pan-genomics là một phương pháp nghiên cứu toàn diện các gen và khối lượng gen của một loài trong toàn bộ dân số của nó, bao gồm cả gen khác nhau giữa các cá thể của cùng một loài. Thay vì chỉ tập trung vào một bộ gen đại diện...

Dịch vụ giải trình tự vận hành như thế nào?

LOBI Việt Nam cung cấp Dịch vụ giải trình tự thế hệ mới (NGS) LB·SEQ với các công nghệ giải trình tự tiên tiến nhất hiện nay, phù hợp với nhiều dự án và đề tài nghiên cứu khác nhau. Quá trình giải trình tự được thực hiện bởi các...

1 Bình luận

Yêu cầu chất lượng và quy cách đóng gói mẫu để thực hiện giải trình tự NGS/Sanger

Yêu cầu chất lượng mẫu Để kiểm tra chất lượng, mẫu cần được điện di trên gel + đo nồng độ và độ tinh sạch. Các yêu cầu cụ thể của từng loại mẫu cần đáp ứng như sau: Nồng độ DNA Tổng thể tích Chỉ số A260/280 Chỉ số...

1 Bình luận

Metagenomics: Chọn V1V2 hay V3V4?

Sau khi đăng bài Phân tích metagenomics: 16S, 18S, ITS hay shotgun?, chúng tôi tiếp tục nhận được câu hỏi: Nên chọn V1V2 hay V3V4 cho nghiên cứu metagenomics? Như các bạn đã biết, 16S rRNA được sử dụng để phân tích đa dạng của các loài vi khuẩn hoặc...