Phân tích Tin Sinh học

Khám phá VFDB: Cơ sở dữ liệu vàng về yếu tố độc lực vi khuẩn

Giới thiệu Yếu tố độc lực (Virulence Factors – VFs) là những “vũ khí” phân tử giúp vi khuẩn gây bệnh, từ bám dính vào tế bào vật chủ đến tiết độc tố phá hủy mô. Hiểu rõ các VFs không chỉ giúp giải mã cơ chế gây bệnh mà...

KEGG PATHWAY: Công Cụ Mạnh Mẽ Phân Tích Hệ Thống Sinh Học

Trong kỷ nguyên dữ liệu lớn (big data) sinh học, việc hiểu cách các gen, protein và chất chuyển hóa tương tác trong tế bào là một thách thức lớn. KEGG PATHWAY (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) ra đời như một giải pháp, giúp các nhà nghiên cứu trực quan hóa và phân...

Giới thiệu về gốc trong cây phân loài

Giới thiệu về gốc trong cây phân loài Gốc của cây phân loài được định nghĩa là điểm đầu tiên trong cây, tương ứng với tổ tiên chung cuối cùng theo lý thuyết của tất cả các đơn vị phân loài có trong cây. Một cây phân loài có gốc...

Pangenome và ý nghĩa của phân tích pangenome

Pangenome và ý nghĩa của phân tích pangenome Phân tích pangenome là một phân tích mới với mục đích nghiên cứu các thành phần hệ gene của một nhóm sinh vật. Thuật ngữ này được giới thiệu lần đầu tiên bởi Tettelin và các cộng sự vào năm 2005. Kết...

Tổng quan về chọn lọc gen trong cải thiện cây ăn quả và rau củ

Trong bài viết này, chúng tôi tóm lược lại nội dung của bài báo review của Lee và cộng sự đăng trên tạp chí Molecular Breeding năm 2024 (DOI: https://doi.org/10.1007/s11032-024-01497-2). Bài báo này là một đánh giá có hệ thống về chọn lọc gen (GS) và ứng dụng của nó trong...

Metagenomics: Phát Hiện Mầm Bệnh Của Mẫu Huyết Tương Từ Bệnh Nhân Bị Nhiễm Trùng Huyết ở Uganda

Trong bài viết này, chúng tôi tóm lược nội dung nghiên cứu được công bố năm 2023 bởi Grundy và cộng sự trên tạp chí Microbiology Spectrum (DOI). Bài báo này trình bày kết quả của một nghiên cứu được thực hiện tại Uganda, nhằm mục đích sử dụng giải...

Quy trình ứng dụng BLUP để dự đoán giá trị giống

BLUP (Best Linear Unbiased Prediction – Dự đoán tuyến tính tốt nhất không chệch) là một phương pháp thống kê mạnh mẽ được sử dụng rộng rãi trong chọn giống động vật và thực vật để dự đoán giá trị giống của các cá thể. Dưới đây là quy trình...

Phân Tích Metagenomics Trong Đất Trồng Lúa: Một Cái Nhìn Chi Tiết

Phân tích metagenomics đã trở thành một công cụ quan trọng trong việc nghiên cứu hệ sinh thái đất trồng lúa, mang đến những hiểu biết sâu sắc về sự đa dạng, chức năng và tương tác phức tạp của cộng đồng vi sinh vật trong môi trường đặc biệt...

Ứng dụng của Metagenomics trong nghiên cứu về đất

Metagenomics là gì? Metagenomics là nghiên cứu vật chất di truyền thu được trực tiếp từ các mẫu môi trường. Thay vì nuôi cấy các vi sinh vật riêng lẻ, metagenomics cho phép các nhà nghiên cứu nghiên cứu toàn bộ cộng đồng vi sinh vật trong môi trường sống...

Các bước cơ bản để tiến hành lắp ráp và chú giải hệ gene

Các bước cơ bản để tiến hành lắp ráp và chú giải hệ gene Hiện nay, với những tiến bộ trong công nghệ giải trình tự, quá trình lắp ráp và chú giải trình tự hệ gene của hầu hết các sinh vật, bao gồm cả hệ gene của sinh...