Blog

BEAST 2: Nền Tảng Mạnh Mẽ cho Phân Tích Tiến Hóa Bayes

BEAST 2: Nền Tảng Mạnh Mẽ cho Phân Tích Tiến Hóa Bayes Trong thế giới sinh học tiến hóa hiện đại, việc hiểu rõ lịch sử phát triển của các loài, các quần thể là vô cùng quan trọng. Dữ liệu trình tự phân tử, cùng với các thông tin...

Suy luận mạng lưới điều hòa gen sử dụng mạng nơ-ron tích chập đồ thị dựa trên tái cấu trúc đặc trưng nguyên nhân – kết quả

Giới thiệu và Vấn đề cần giải quyết Mạng lưới điều hòa gen (GRN) mô tả các mối quan hệ điều hòa phức tạp giữa các gen và là một trong những công cụ chính giúp các nhà nghiên cứu phân tích và hiểu các quá trình sinh học ở...

scDiffusion: Tạo dữ liệu tế bào đơn chất lượng cao sử dụng mô hình khuếch tán

Tổng quan và Đặt vấn đề Dữ liệu scRNA-seq cung cấp mô tả toàn diện về hồ sơ biểu hiện gen của mỗi tế bào đơn lẻ, giúp hiểu rõ hơn về sự phát triển và chức năng của các sinh vật sống. Mặc dù công nghệ giải trình tự...

Khám Phá Bí Mật Sinh Học: Chọn Lọc Đặc Trưng và Phân Tích k-mer trong Tin Sinh Học

Trong lĩnh vực tin sinh học đang phát triển nhanh chóng, việc trích xuất những hiểu biết có ý nghĩa từ các tập dữ liệu bộ gen và proteomic khổng lồ là một nhiệm vụ quan trọng. Hai kỹ thuật cốt lõi thúc đẩy tiến trình này là chọn lọc...

Tóm tắt Nghiên cứu PLM-ATG về Xác định Protein Tự Thực

  Tổng quan và đặt vấn đề Tự thực bào (Autophagy) là một con đường lysosomal được bảo tồn tiến hóa và điều chỉnh chặt chẽ, giúp phân giải các đại phân tử như protein, glycogen, lipid và nucleotide. Quá trình tự thực bào được điều hòa chặt chẽ bởi...

Mạng nơ-ron học sâu trong dự đoán bộ gen thực vật

Tổng quan và đặt vấn đề Dự đoán bộ gen (Genomic Prediction – GP) là một phương pháp hiệu quả để dự đoán các tính trạng kiểu hình từ thông tin kiểu gen, giúp đẩy nhanh quá trình cải thiện tính trạng trong chọn giống cây trồng. Các phương pháp...

Phân tích hiệu quả và tái lập trong Tin sinh

Phân tích hiệu quả và tái lập trong Tin sinh Thế kỷ XXI chứng kiến một cuộc cách mạng trong nghiên cứu sinh học, lâm sàng và dược lý nhờ vào sự phát triển vượt bậc của các công nghệ giải trình tự thông lượng cao (high-throughput technologies).  Các công...

AlphaFold: Bước Đột Phá trong Dự Đoán Cấu Trúc Protein

AlphaFold: Bước Đột Phá trong Dự Đoán Cấu Trúc Protein Protein là những phân tử có cấu trúc phức tạp trong mọi sinh vật sống, đóng vai trò thiết yếu trong hầu hết các quá trình sinh học. Hiểu được cấu trúc ba chiều (3D) của protein là chìa khóa...

NVIDIA Parabricks: Cách Mạng Hóa Phân Tích Hệ Gen Với Sức Mạnh GPU

Giới thiệu Trong kỷ nguyên bùng nổ của dữ liệu hệ gen, việc xử lý nhanh chóng và hiệu quả các bộ dữ liệu khổng lồ từ công nghệ giải trình tự thế hệ mới (Next Generation Sequencing – NGS) là một thách thức lớn. NVIDIA Parabricks, một bộ phần...

AUGUSTUS: Công Cụ Mạnh Mẽ Dự Đoán Gen Trong Tin Sinh Học

Giới Thiệu Trong lĩnh vực tin sinh học, việc dự đoán gen (gene prediction) là một bước quan trọng trong chú giải bộ gen (genome annotation). Trong số các công cụ hiện có, AUGUSTUS nổi bật nhờ độ chính xác cao và khả năng xử lý các bộ gen sinh vật nhân thực (eukaryotes). Được phát triển...