AUGUSTUS: Công Cụ Mạnh Mẽ Dự Đoán Gen Trong Tin Sinh Học

Giới Thiệu Trong lĩnh vực tin sinh học, việc dự đoán gen (gene prediction) là một bước quan trọng trong chú giải bộ gen (genome annotation). Trong số các công cụ hiện có, AUGUSTUS nổi bật nhờ độ chính xác cao và khả năng xử lý các bộ gen sinh vật nhân thực (eukaryotes). Được phát triển...

OLAF: Cách Mạng Hóa Tin Sinh Học với AI Đàm Thoại

Giới thiệu Dữ liệu sinh học ngày càng phức tạp, từ bộ gen đến proteomics, khiến nhiều nhà khoa học sự sống gặp khó khi phân tích mà không biết lập trình. OLAF (Open Life Science Analysis Framework) là một nền tảng mã nguồn mở sử dụng AI ngôn ngữ...

Khám phá VFDB: Cơ sở dữ liệu vàng về yếu tố độc lực vi khuẩn

Giới thiệu Yếu tố độc lực (Virulence Factors – VFs) là những “vũ khí” phân tử giúp vi khuẩn gây bệnh, từ bám dính vào tế bào vật chủ đến tiết độc tố phá hủy mô. Hiểu rõ các VFs không chỉ giúp giải mã cơ chế gây bệnh mà...

KEGG PATHWAY: Công Cụ Mạnh Mẽ Phân Tích Hệ Thống Sinh Học

Trong kỷ nguyên dữ liệu lớn (big data) sinh học, việc hiểu cách các gen, protein và chất chuyển hóa tương tác trong tế bào là một thách thức lớn. KEGG PATHWAY (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) ra đời như một giải pháp, giúp các nhà nghiên cứu trực quan hóa và phân...

Tổng Quan về Cơ Sở Dữ Liệu PharmGKB: Nền Tảng Kiến Thức Dược Lý trong Y Học Cá Nhân Hóa

Giới Thiệu PharmGKB (Cơ sở Dữ liệu Tri thức Dược lý) là một nguồn tài nguyên quan trọng giúp thu thập, sắp xếp và chia sẻ thông tin về cách các khác biệt di truyền ảnh hưởng đến phản ứng với thuốc. Ra đời năm 2000 với sự hỗ trợ...

Khám Phá Drug Central: Kho Dữ Liệu Thuốc Toàn Diện Cho Cộng Đồng Y Dược

Giới Thiệu Về Drug Central Drug Central (http://drugcentral.org) là một cơ sở dữ liệu thuốc mã nguồn mở, cung cấp thông tin đa chiều về các hoạt chất dược phẩm (API) đã được phê duyệt. Từ cấu trúc hóa học, hoạt tính sinh học, đến thông tin pháp lý và dữ...

Khám Phá DrugBank Dưới Góc Nhìn Của Nhà Phân Tích Tin Sinh Học

Giới Thiệu Trong bối cảnh phát triển nhanh chóng của tin sinh học và khám phá thuốc, các cơ sở dữ liệu như DrugBank đóng vai trò quan trọng. Đây là một trong những cơ sở dữ liệu hàng đầu chứa thông tin về thuốc và mục tiêu thuốc, giúp...

Flye và Xử Lý Dữ Liệu Từ Oxford Nanopore

Giới thiệu về Flye Flye là một phần mềm lắp ráp bộ gen de novo được thiết kế đặc biệt cho dữ liệu trình tự dài, chẳng hạn như dữ liệu từ công nghệ Oxford Nanopore. Công cụ này hoạt động dựa trên đồ thị de Bruijn và thuật toán...

Nghiên cứu về circle RNA với ứng dụng của tin sinh học

Giới thiệu RNA vòng (circle RNA) là một loại RNA nội sinh có cấu trúc vòng khép kín, giúp chúng có độ ổn định cao hơn so với RNA tuyến tính. Dù được phát hiện từ những năm 1970, circle RNA chỉ mới thu hút sự chú ý gần đây...

scGPT: Mô Hình Transformer Mới Cho Phân Tích Dữ Liệu RNA-seq

Giới Thiệu Trong những năm gần đây, phân tích dữ liệu RNA đơn bào (RNA-seq) đã trở thành một trong những hướng nghiên cứu quan trọng trong tin sinh học. Tuy nhiên, khối lượng dữ liệu khổng lồ hàng triệu tế bào và biểu hiện gen phức tạp đòi hỏi...