fbpx

BIC24: Comprehensive Bioinformatic Analysis of Bacterial Genome using Long and Short Reads

LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.

ĐỌC THÊM:  Best practices trong phân tích 16S/ITS metagenomics

BIC24: Comprehensive Bioinformatic Analysis of Bacterial Genome using Long and Short Reads

Giới thiệu khóa học

Được tiếp nối và cải tiến từ các khóa học BIC15, BIC16, BIC21 và BIC23, khóa học BIC24 với chủ đề Phân Tích Toàn diện Hệ Gen Vi Khuẩn sẽ cung cấp cho học viên những kiến thức tổng quan và chuyên sâu về phân tích dữ liệu trình tự toàn hệ gen vi khuẩn. Các nội dung chính bao gồm:

  • Đánh giá và sàng lọc dữ liệu.
  • Các chiến lược lắp ráp hệ gen với dữ liệu long reads và short reads.
  • Dự đoán & chú giải hệ gen vi khuẩn.
  • Dự đoán gen kháng kháng sinh, gen độc lực, …
  • Phân tích MLST, Phylogeny, Pan-Genome, …
  • Dóng hàng và gọi biến thể.

Khóa học được thiết kế theo phương pháp Hands-on, học viên sẽ được thực hành trên dữ liệu thực, dự án thực.

Kết thúc khóa học, học viên được nhận “Chứng chỉ hoàn thành khóa học” do LOBI Việt Nam cung cấp.

Khóa học phân tích hệ gen vi khuẩn tự hào có đội ngũ giàu kinh nghiệm và uy tín trong lĩnh vực Tin Sinh học:

  • Ts. Nguyễn Thụy Vy – Giảng viên khoa Công Nghệ sinh học trường Đại học Khoa Học Tự Nhiên – TP. Hồ Chí Minh (VNUHCM).
  • Ts.Trần Thị Thanh Tâm – Giảng viên khoa Công nghệ sinh học trường Đại học Khoa học và Công nghệ Hà Nội (USTH).
  • Ts. Nguyễn Cường – CEO/ Founder công ty TNHH LOBI Việt Nam.

Mục tiêu khóa học

Sau khóa học, học viên sẽ nắm vững và tự mình thực hiện được các bước phân tích toàn hệ gen mẫu vi sinh vật, bao gồm:

  • Hiểu rõ được dữ liệu đọc trình tự gen thế hệ mới.
  • Đánh giá chất lượng dữ liệu giải trình tự thế hệ mới.
  • Lắp ráp, chú giải, định danh hệ gen.
  • Xác định gen kháng kháng sinh và độc lực.
  • Xác định MLST và độ tương đồng.
  • Phân nhóm chức năng.
  • Gọi và chú giải biến thể.
  • Trực quan hóa hệ gen.
  • Vẽ cây phân loài
ĐỌC THÊM:  Tổng quan về Tin sinh học

Đối tượng khóa học

Khóa học này dành cho:

  • Sinh viên từ năm nhất có chuyên ngành sinh học, công nghệ sinh học, và các ngành liên quan.
  • Các Nghiên cứu sinh có quan tâm tới lĩnh vực phân tích tin sinh.

Yêu cầu đầu vào

  • Kiến thức: Học viên cần có kiến thức căn bản về sinh học phân tử.
  • Trang thiết bị bắt buộc: Laptop có cấu hình trung bình trở lên.

Nội dung khóa học

 

Thời gian Nội Dung
Buổi 1
  • Giải trình tự toàn bộ hệ gen vi khuẩn: Từ thu mẫu đến giải trình tự và tổng quan phân tích dữ liệu.
Buổi 2
  • Giới thiệu chung về tin sinh học và hệ gen vi khuẩn.
  • Đánh giá và tiền xử lý dữ liệu.
Buổi 3
  • Lắp ráp và đánh giá chất lượng lắp ráp.
  • Chú giải hệ gen vi khuẩn.
Buổi 4
  • Xác định gen kháng kháng sinh và độc lực.
  • Xác định MLST và độ tương đồng.
  • Phân nhóm chức năng gen.
Buổi 5
  • Gọi biến thể.
  • Chú giải biến thể.
Buổi 6
  • Trực quan hóa hệ gen.
  • Vẽ cây phân loài.

 

  • Ngôn ngữ giảng dạy: Tiếng việt.
  • Nền tảng thực hành phân tích: Galaxy.
  • Sever dùng để phân tích sẽ được LOBI cung cấp trong suốt thời gian khóa học.

Thời gian và Địa điểm

  • Thời gian: 19 – 21/07/2024 (Thứ 6, 7 và CN)
  • Địa điểm: 25 Vũ Ngọc Phan, Láng Hạ, Đống Đa, Hà Nội.

Học phí

Học viên  Thời hạn đăng ký 

và nộp học phí

Học Phí Ưu đãi
Đăng ký sớm trước 04/07/2024 4,500,000 VNĐ Giảm 1.000.000 VNĐ cho học viên là sinh viên đại học
Đăng ký thường từ 04/07/2024 

đến 10/07/2024

6,000,000 VNĐ

Ghi chú:

  • Đăng ký sớm được ghi nhận khi hoàn thành nộp học phí trong thời hạn.
  • Học phí đã bao gồm chi phí ăn trưa 3 ngày, tài liệu in ấn, tea break.

Cách thức đăng ký

  • Học viên đăng ký theo Google form ở link: https://forms.gle/QR3UrEUyrQWvu1ER9.
  • Vui lòng liên hệ tới zalo/hotline: 092.510.8899 hoặc email: info@lobi.vn để được hỗ trợ, tư vấn hoặc đăng ký ngay.
  • Hướng dẫn thanh toán học phí sẽ được gửi sau khi học viên hoàn tất đăng ký.
  • Đối với học viên là sinh viên, vui lòng đính kèm ảnh thẻ sinh viên để được nhận học phí ưu đãi.
  • Do số lượng học viên tối đa là khoảng 24 người/khóa để đảm bảo chất lượng nên đơn đăng ký có thể đóng trước hạn nếu đã nhận đủ học viên. 

Liên hệ

Mọi thắc mắc và đóng góp xin liên hệ:

  • SĐT: 092.510.8899
  • Email: info@lobi.vn

LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.

ĐỌC THÊM:  iDoComp: Một lược đồ thu gọn cho các genome được lắp ráp

Trả lời

Email của bạn sẽ không được hiển thị công khai. Các trường bắt buộc được đánh dấu *