MolabIS – An integrated information system for storing and managing molecular genetics data
Author: Cong VC Truong, Linn F Groeneveld, Burkhard Morgenstern and Eildert Groeneveld
Bối cảnh: Lưu trữ, theo dõi lâu dài lưu lượng và việc truy cập dữ liệu để thực hiện các phân tích sâu hơn đóng vai trò rất quan trọng trong nghiên cứu genetics. Do đó, một hệ thống thông tin hợp lý được sử dụng để quản lý lượng dữ liệu ngày càng lớn từ nhiều dự án khác nhau là rất cần thiết đối với mỗi phòng thí nghiệm sinh học phân tử.
Kết quả: Nghiên cứu này đã phát triển một hệ thống quản lý thông tin cho phòng thí nghiệm sinh học phân tử (molecular labs information management system – MolabIS). Hệ thống này được phát triển trên nền web, cho phép người dùng lấy lại dữ liệu ban đầu ở mỗi bước trong quy trình. MolabIS cung cấp những chức năng cơ bản trong việc quản lý thông tin của các cá thể, theo dõi các mẫu thí nghiệm và vị trí lưu trữ, lấy lại dữ liệu thô, nhập dữ liệu cuối cùng từ một tệp ngoài, tìm kiếm kết quả, truy cập và thay đổi dữ liệu. Một số chức năng quan trọng khác có mặt trong hệ thống là các thiết lập để tạo ra báo cáo định dạng bản in, chuyển đổi trình tự và dữ liệu microsatellite thành nhiều định dạng khác nhau để sử dụng trong những phân tích sâu hơn. Bên cạnh đó, MolabIS cũng cung cấp công cụ để di dời dữ liệu.
Kết luận: MolabIS được thiết kế để lưu trữ và quản lý hiệu quả một lượng tương đối lớn dữ liệu, dành cho những phòng thí nghiệm có quy mô nhỏ và vừa, thực hiện quy trình giải trình tự bằng phương pháp Sanger và nghiên cứu kiểu gen microsatellite. MolabIS không chỉ giúp tiết kiệm thời gian mà còn đảm bảo dữ liệu có thể được dễ dàng truy cập và sử dụng cho những phân tích tiếp theo. Phần mềm này được phát triển theo gói có thể chạy trên nhiều hệ thống khác nhau (Linux, Windows). MolabIS có thể được phân phối rộng rãi tại các phòng thí nghiệm di truyền phân tử do được phát triển theo mô hình dữ liệu chung. MolabIS được phát hành bởi GPL và được sử dụng miễn phí tại địa chỉ http://www.molabis.org
Full article: http://www.biomedcentral.com/1471-2105/12/425
LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.
