Ứng dụng các phương pháp học máy dựa vào pan-genome dùng để phân tích các hoạt động kháng kháng sinh của chủng Escherichia coli

Ứng dụng các phương pháp học máy dựa vào pan-genome dùng để phân tích các hoạt động kháng kháng sinh của chủng Escherichia coli Hiện nay, các chủng vi khuẩn kháng kháng sinh gây bệnh đang là một vấn đề lớn trên thế giới. Các mầm bệnh do chúng gây...

Nguồn gốc và sự tiến hóa ban đầu của thực vật

Nguồn gốc và sự tiến hóa ban đầu của thực vật Archaeplastida là tên gọi chung cho tổ tiên của thực vật, được đặt tên theo sự kiện nội cộng sinh nguyên thủy giữa một sinh vật nhân chuẩn và một vi khuẩn lam. Từ Archaeplastida, các nhóm Rhodophyta (Tảo...

Giới thiệu về gốc trong cây phân loài

Giới thiệu về gốc trong cây phân loài Gốc của cây phân loài được định nghĩa là điểm đầu tiên trong cây, tương ứng với tổ tiên chung cuối cùng theo lý thuyết của tất cả các đơn vị phân loài có trong cây. Một cây phân loài có gốc...

Pangenome và ý nghĩa của phân tích pangenome

Pangenome và ý nghĩa của phân tích pangenome Phân tích pangenome là một phân tích mới với mục đích nghiên cứu các thành phần hệ gene của một nhóm sinh vật. Thuật ngữ này được giới thiệu lần đầu tiên bởi Tettelin và các cộng sự vào năm 2005. Kết...

Khoá học BIC-OD6: Virus genome analysis

Ngày 22-23/11/2024, LOBI Vietnam hợp tác với Công ty TNHH Dược Hanvet tổ chức thành công khóa học tin sinh “BIC-OD6: Virus genome analysis” với mục tiêu kết hợp lý thuyết và thực hành hoàn thành một quy trình phân tích hệ gene virus cơ bản. Các khóa học do...

Đồ thị genome tham chiếu – phương pháp tiềm năng cho biểu diễn genome tham chiếu

1. Giới thiệu Genome tham chiếu là một chuỗi DNA được sử dụng làm khuôn mẫu để so sánh và phân tích dữ liệu trình tự của các cá thể khác trong cùng loài. Genome tham chiếu truyền thống được biểu diễn dưới dạng tuyến tính, là một chuỗi đơn...

Hệ vi sinh vật đường ruột và bệnh tiểu đường

Hệ vi sinh vật, bao gồm vi khuẩn, nấm và vi rút, đóng một vai trò quan trọng trong nhiều chức năng của cơ thể con người, bao gồm chuyển hóa, miễn dịch và thậm chí cả sức khỏe tâm thần. Sự mất cân bằng trong hệ vi sinh vật...

Kỹ thuật Genotyping by Sequencing là gì và hoạt động như thế nào?

GBS (Genotyping-by-Sequencing) là một kỹ thuật hiện đại trong lĩnh vực di truyền học, được sử dụng để xác định kiểu gen của các cá thể một cách nhanh chóng và chính xác. Đây là một công cụ mạnh mẽ trong nhiều lĩnh vực, từ nghiên cứu nông nghiệp đến...

Tổng quan về chọn lọc gen trong cải thiện cây ăn quả và rau củ

Trong bài viết này, chúng tôi tóm lược lại nội dung của bài báo review của Lee và cộng sự đăng trên tạp chí Molecular Breeding năm 2024 (DOI: https://doi.org/10.1007/s11032-024-01497-2). Bài báo này là một đánh giá có hệ thống về chọn lọc gen (GS) và ứng dụng của nó trong...

Ứng dụng quy trình phân tích pangenome trong xác định các gene chức năng ở lúa

Ứng dụng quy trình phân tích pangenome trong xác định các gene chức năng ở lúa Lúa (Oryza sativa) là một loại cây lương thực quan trọng nhất, nuôi sống gần một nửa dân số thế giới. Khi dân số tăng lên 10 tỷ người, nhu cầu cấp bách là...