Công nghệ mới trong phát hiện các loại virus mới ở gia cầm

Trong việc tìm kiếm các phương pháp hữu hiệu hơn để kiểm soát các bệnh từ virus đường ruột ở gia cầm, các nhà khoa học tại Bộ Nông nghiệp Mỹ (USDA) đã khám phá ra các loại virus ở gia cầm bằng cách sử dụng một công cụ phân tử hữu hiệu mới được gọi là metagenomics.

Trong việc tìm kiếm các phương pháp hữu hiệu hơn để kiểm soát các bệnh từ virus đường ruột ở gia cầm, các nhà khoa học tại Bộ Nông nghiệp Mỹ (USDA) đã khám phá ra các loại virus ở gia cầm bằng cách sử dụng một công cụ phân tử hữu hiệu mới được gọi là metagenomics.

Mỗi năm, các rối loạn như hội chứng hoại tử đường ruột ở gà, rối loạn đường ruột ở gà, và hội chứng suy nhược và còi cọc là nguyên nhân của bệnh tiêu chảy ở gà tây và gà thịt, dẫn đến giảm trọng lượng, gây tử vong và khiến chi phí sản xuất tăng. Một số virus là nguyên nhân gây nên các bệnh đường ruột, nhưng các nhà khoa học không phát hiện thấy tác nhân gây bệnh riêng lẻ nào.

Không giống như trình tự truyền thống quy định đặc trưng gen trong một sinh vật đơn lẻ nào đó, kỹ thuật metagenomics phát hiện ra acid nucleic của hàng ngàn sinh vật trong quần thể. Bằng cách sử dụng kỹ thuật này, Laszlo Zsak – người chủ trì nghiên cứu tại Đơn vị Nghiên cứu bệnh do virus đặc thù ở gia cầm trực thuộc cơ quan Nghiên cứu Nông nghiệp (ARS) tại Phòng thí nghiệm nghiên cứu gia cầm khu vực Đông Nam tại Athens, bang Georgia, đã phát hiện ra một loại virus mới có khả năng ứng dụng trong sản xuất một loại kháng sinh trong tương lai.

Zsak và nhà vi sinh vật học tại ARS là Michael Day ở Athens, đã tìm thấy một chuỗi ngắn ADN của các virus mới được phát hiện và đã xây dựng một kỹ thuật để lập trình tự toàn bộ hệ gen của nó. Virus này được gọi là “phiCA82,” – là loại virus giết chết vi khuẩn một cách tự nhiên và nằm trong một nhóm có tên gọi là “tiểu thực bào” hoặc thể thực khuẩn có khả năng sẽ được sử dụng như là một giải pháp thay thế thuốc kháng sinh và là công cụ để chống lại tác nhân đa kháng thuốc.

Trong nghiên cứu, các nhà khoa học đã tách và phân tích axit nucleic từ các mẫu ruột gia cầm được thu thập từ các đàn gia cầm thương phẩm bị nhiễm bệnh đường ruột ở Mỹ. Bên cạnh thể thực khuẩn mới lạ này, những vi rút thường gặp ở gia cầm như astrovirus, reovirus và rotavirus, và virus RNA thuộc nhóm Picornaviridae đã được phát hiện thấy. Tuy nhiên, các nhà khoa học rất ngạc nhiên khi khám phá ra virus ở gà tây mà trước đây chưa được biết đến như picobirnavirus – một loại virus liên quan đến bệnh đường ruột ở vật nuôi khác, và calicivirus – một loại virus có liên quan tới các bệnh đường ruột của con người.

Trong các nghiên cứu trước đó, Zsak và Day đã sử dụng kỹ thuật metagenomics để xác định và lần đầu tiên phân tích bộ gen hoàn chỉnh của parvovirus ở gà. Họ cũng phát triển một thử nghiệm phản ứng cho phản ứng chuỗi polymerase (PCR-polymerase) có tính nhạy cảm cao và rành mạch trong việc phát hiện virus ở gia cầm.

Nghiên cứu được đăng tải trên tạp chí Nghiên cứu Nông nghiệp số ra tháng 4/2012.

Thanh Thu (Theo ARS)