Molecular Characteristics of Rifampin- and Isoniazid-Resistant Mycobacterium tuberculosisStrains Isolated in Vietnam
Minh NN, Van Bac N, Son NT, Lien VT, Ha CH, Cuong NH, Mai CT, Le TH.
Institute of Biotechnology, Vietnam Academy of Science and Technology, Hospital 103, Vietnam Military Medical University, Vietnam. nghiemminh@ibt.ac.vn
Tóm lược
Đặc điểm phân tử giữa các chủng vi khuẩn lao kháng thuốc có nguồn gốc khác nhau là những thông tin rất có ý nghĩa trong việc phát triển các phương pháp phân tử. Các phương pháp này đã được ứng dụng rộng rãi nhằm tìm kiếm nhanh các chủng kháng thuốc. Có tất cả 166 chủng khuẩn lao kháng thuốc rifampin (RIF) và isoniazid (INH) được phân lập từ các vùng khác nhau của Việt Nam, sau đó sử dụng phương pháp phân tích trình tự để tìm ra các đột biến liên quan đến kháng thuốc RIF và INH. Kết quả cho thấy có 17 đột biến được tìm thấy trong 74 chủng kháng thuốc RIF, 56 chủng trong tổng số 74 chủng (76%) có đột biến ở vị trí hot-spot 81bp gene rpoB. Đột biến gen rpoB chủ yếu xảy ra ở các vị trí codon thứ 531 chiếm (37,8%), 526 chiếm (23%) và 516 chiếm (9,46%). Có rất ít đột biến không xuất hiện ở cả 3 chủng (4,05%). Trong trường hợp kháng INH, tìm thấy 5 đột biến nằm trong gene katG của 82 chủng kháng thuốc, chủ yếu là thay thế nucleotit ở vị trí codon 315 chiếm (76,38%). Nghiên cứu này cung cấp đặc điểm di truyền của các chủng vi khuẩn lao kháng thuốc INH và RIF đầu tiên tại Việt Nam, và phát hiện các đột biến ở gen katG và rpoB sẽ giúp nhanh chóng xác định được các chủng kháng thuốc RIF và INH bằng các xét nghiệm phân tử.
Link trên PMC của NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3295148/
{fcomment}
LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.