Đảm bảo chất lượng hệ gen

Đảm bảo chất lượng của việc lắp ráp hệ gen và chú giải hệ gen là rất quan trọng, nếu chất lượng thấp thì nó sẽ gây ra nhiều hậu quả bởi vì sẽ có nhiều nhóm nghiên cứu khác sử dụng hệ gen này làm tham chiếu cho việc nghiên cứu của họ. Do đó, đảm bảo chất lượng hệ gen là phần quan trọng của tất cả các dự án.

Vấn đề then chốt của việc đảm bảo chất lượng hệ gen là không có hệ gen tham chiếu mà từ đó có thể xác định được mức độ chính xác. Phương pháp thực nghiệm để kiểm nghiệm chất lượng hệ gen là phương pháp chính xác nhất, tuy nhiên chi phí cả về thời gian, công sức và tài lực đều đắt đỏ, do đó thường là không khả thi với các dự án cỡ vừa và nhỏ. Hiện nay, một số phương pháp đảm bảo chất lượng hệ gen đang được phát triển:

• Xác định xem hệ gen đã được chú giải có bao nhiêu % protein có domain đã biết bằng cách đối sánh với các CSDL domains đã được kiểm chứng như là InterProScan, Pfam, ….
• Phương pháp khác là đối sánh các cấu trúc intron-exon của gen được chú giải với thư viện EST hoặc trình tự RNA.