Trong nghiên cứu tin sinh học, Gene Ontology (GO) và Sequence Ontology (SO) là hai hệ thống quan trọng giúp chuẩn hóa thông tin về chức năng gene và cấu trúc trình tự sinh học.
- Gene Ontology (GO) – Mô tả chức năng gene
GO cung cấp một hệ thống phân loại chức năng gene thành ba nhóm chính:
- Biological Process (BP): Các quá trình sinh học mà gene tham gia (ví dụ: trao đổi chất, apoptosis).
- Molecular Function (MF): Chức năng phân tử của gene/protein (ví dụ: enzyme activity, binding).
- Cellular Component (CC): Vị trí của gene/protein trong tế bào (ví dụ: ty thể, ribosome).
GO được sử dụng trong phân tích dữ liệu omics, nghiên cứu bệnh di truyền và so sánh chức năng gene giữa các loài.
- Sequence Ontology (SO) – Mô tả đặc điểm trình tự sinh học
SO định nghĩa các thành phần của trình tự DNA, RNA, và protein, bao gồm:
- Gene: Đoạn mã hóa protein hoặc RNA chức năng.
- Exon & Intron: Thành phần của gene, trong đó exon được giữ lại sau cắt intron.
- Promoter: Vùng điều hòa khởi động phiên mã.
- SNP (Single Nucleotide Polymorphism): Biến dị đơn nucleotide trong hệ gene.
SO được ứng dụng trong chú thích genome và nghiên cứu biến dị di truyền.
- So sánh GO & SO
| Tiêu chí | Gene Ontology (GO) | Sequence Ontology (SO) |
| Mục đích chính | Mô tả chức năng gene | Mô tả cấu trúc trình tự sinh học |
| Phạm vi | Quá trình sinh học, chức năng phân tử, vị trí tế bào | DNA, RNA, protein và các biến thể |
| Ứng dụng | Phân tích dữ liệu omics, nghiên cứu y sinh | Chú thích hệ gene, phân tích biến dị di truyền |
Kết luận
GO và SO đều là công cụ không thể thiếu trong tin sinh học. GO tập trung vào chức năng gene, trong khi SO mô tả cấu trúc trình tự sinh học. Cả hai hỗ trợ nghiên cứu hệ gene, phân tích dữ liệu sinh học và khám phá cơ chế bệnh di truyền.
LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.
