Dự án 1KP (Dự án 1000 hệ gene Thực vật) là một nỗ lực quy mô lớn đầu tiên nhằm thu thập dữ liệu giải trình tự thế hệ mới (NGS) của nhánh Viridiplantae (Thực vật xanh). Đây là một nhánh bao gồm khoảng 500000 loài, chủ yếu thuộc nhóm thực vật trên cạn (Embryophytes) và tảo lục. Dự án này được khởi dộng vào năm 2009 tại British Columbia University (Canada).

1KP tập trung chủ yếu vào nghiên cứu các khía cạnh tiến hóa của thực vật xanh, khảo sát các sự kiện đa bội (WGD) xảy ra trong lịch sử tiến hóa của thực vật, khám phá các protein mới ứng dụng trong các nghiên cứu quang di truyền trong lĩnh vực khoa học thần kinh ở động vật có vú và giải mã mạng lưới di truyền (mạng lưới quan hợp C4). Đến nay, dự án đã tạo giải trình tự 1342 dữ liệu transcriptome từ 1173 loài trong Viridiplantae. Điều này làm tăng đáng kể số lượng genes, giúp hoàn thiện được cơ sở dữ liệu liên quan đến thực vật xanh. Đồng thời còn cung cấp một cây phát sinh loài tham chiếu cho nhóm Viridiplantae từ các trình tự gene được mã hóa trong lạp thể và 410 gene bảo tồn từ dữ liệu phiên mã. Một phát hiện lớn nữa liên quan đến các sự kiện đa bội, bao gồm: 244 sự kiện WGD, trong đó cáo 138 sự kiện chưa được báo cáo trước đây.

Tất cả các kết quả này đã góp phần quan trọng trong việc thúc đẩy sự hiểu biết của chúng ta về quá trình tiến hóa của thực vật. Dựa vào các kết quả này, nhiều nghiên cứu tiếp theo về sự tiến hóa, sinh thái, và ứng dụng công nghệ sinh học của thực vật sẽ trở nên dễ dàng và thuận tiện hơn rất nhiều.

Nguồn ảnh: https://www.nature.com/articles/s41586-019-1693-2

Tham khảo: https://www.annualreviews.org/content/journals/10.1146/annurev-arplant-042916-041040