fbpx

Phân tích metagenomics dạ cỏ Trâu Ấn Độ – Nguồn tiềm năng lớn cho việc tìm ra các enzyme phân giải sinh khối

LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.

ĐỌC THÊM:  Nghiên cứu, giảng dạy sinh học ở Việt Nam: Khi đa dạng sinh học báo động suy thoái

High Potential Source for Biomass Degradation Enzyme Discovery and Environmental Aspects Revealed through Metagenomics of Indian Buffalo Rumen

Singh KM1, Reddy B2, Patel D2, Patel AK2, Parmar N2, Patel A2, Patel JB3, Joshi CG2

Ý tưởng bài báo cho rằng: Quần thể vi sinh vật tồn tại trong dạ cỏ của Trâu rất đa dạng và phức tạp, điều này có liên quan đến quá trình phân giải thành tế bào thực vật trong dạ cỏ. Vì vậy, nghiên cứu hệ vi sinh vật trong dạ cỏ có thể tìm ra những enzym có chức năng phân giải thành tế bào thực vật phục vụ cho các quá trình sản xuất nhiên liệu sinh học là việc làm cần thiết.

Với bộ dữ liệu metagenomics khoảng 3,9 GB trình tự, nhóm nghiên cứu đã lắp ráp được 137.270 contigs. Trong đó có 2.614 contigs mã hóa cho các enzym phân giải sinh khối bao gồm glycoside hydrolases (GH: 1943 contigs), carbohydrate binding module (CBM: 23 contigs), glycosyl transferase (GT: 373 contigs), carbohydrate esterases (CE: 259 contigs), và polysaccharide lyases (PE: 16 contigs). Phân tích metagenomics cũng cho thấy mức độ giống và khác nhau về cấu trúc cũng như chức năng của quần thể vi sinh vật tồn tại trong dạ cỏ. Từ đó nhóm nghiên cứu đã tìm ra một số lượng lớn gen liên quan đến quá trình phân giải sinh khối và có thể sẽ được áp dụng cho ngành sản xuất nguyên liệu sinh học.

ĐỌC THÊM:  Di truyền trong nghiên cứu ung thư: Vùng DNA không mã hóa đã được giải mã

Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4124647/

LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.

ĐỌC THÊM:  Phần mềm miễn phí trong tin sinh học

Trả lời

Email của bạn sẽ không được hiển thị công khai. Các trường bắt buộc được đánh dấu *