Việc tạo giống nho (Vitis vinifera) đã bước vào một giai đoạn quan trọng. Các giống mới kháng bệnh phấn trắng và bệnh nấm mốc sương mai được ra mắt hàng năm. Tuy nhiên, quy trình chọn giống truyền thống vẫn mất nhiều thời gian và công sức, thường kéo dài từ 20 đến 25 năm, đồng thời cần đánh giá các đặc tính mới để cải thiện khả năng thích ứng của nho với biến đổi khí hậu. Trước đây, quá trình chọn lọc chủ yếu phụ thuộc vào dữ liệu kiểu hình và một số lượng hạn chế các marker phân tử liên quan đến các đặc tính di truyền đơn giản như khả năng kháng bệnh, mà không có một kiểu hình mẫu lý tưởng rõ ràng, và thường được thực hiện trên quy mô lớn.
Để thúc đẩy quá trình chọn giống và giải quyết những thách thức này, nhóm tác giả đã nghiên cứu việc áp dụng dự đoán gen, một phương pháp sử dụng các marker phân tử để dự đoán giá trị kiểu gen. Nghiên cứu này tập trung vào hai chương trình lai tạo nho hiện có: sản xuất rượu vang Rosé và rượu vang Cognac. Trong các chương trình này, nhiều họ nho đã được tạo ra thông qua phép lai giữa các giống biểu tượng và các giống kháng bệnh phấn trắng và bệnh nấm mốc sương mai. Ba mươi tính trạng đã được đánh giá cho mỗi chương trình bằng cách sử dụng hai phương pháp dự đoán gen: Genomic Best Linear Unbiased Predictor (GBLUP) và Least Absolute Shrinkage Selection Operator (LASSO).
Kết quả cho thấy có sự biến đổi đáng kể trong khả năng dự đoán giữa các tính trạng, dao động từ 0 đến 0,9. Những chênh lệch này có thể được quy cho các yếu tố như tính di truyền của tính trạng và các đặc điểm của tính trạng đó. Hơn nữa, khả năng dự đoán gen được khám phá bằng cách sử dụng các quần thể nho khác làm tập huấn luyện. Việc tích hợp dự đoán gen cho phép xác định các cá thể vượt trội cho mỗi chương trình thông qua phương pháp chỉ số chọn lọc đa biến. Kiểu hình mẫu lý tưởng cho mỗi chương trình tạo giống được xác định từ sự kết hợp của nhiều lĩnh vực trồng nho.
Nguồn: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10989862/
Người dịch: Vương Hương
LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.
