fbpx

VCF2Networks: Ứng dụng phân tích mạng lưới kiểu gen sử dụng SNP

LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.

ĐỌC THÊM:  Những ứng dụng nổi trội của 16S amplicon sequencing?

Hiện nay với nhiều dự án giải trình tự toàn bộ hệ gen đã mở ra những phương hướng nghiên cứu về mối liên kết giữa kiểu gen và kiểu hình. Một trong những hướng nghiên cứu đó là phân tích mạng lưới kiểu gen sử dụng dữ liệu di truyền cộng đồng. Mạng lưới kiểu gen là sự tái hiện của một bộ những kiểu gen được tìm thấy trên cùng một kiểu hình, cho phép đánh giá mức độ biểu hiện kiểu hình của một đột biến, và khả năng những kiểu gen được tìm thấy sẽ phát triển thành một kiểu thích nghi mới.

Cho đến nay, phân tích mạng lưới kiểu gen sử dụng dữ liệu di truyền cộng đồng còn rất hiếm. Chính vì lý do đó, chúng tôi giới thiệu VCF2Networks, cộng cụ để phát hiện và nghiên cứu cấu trúc mạng lưới kiểu gen từ dữ liệu SNP. Các bạn có thể đọc thêm thông tin chi tiết và tải công cụ VCF2Networks tại địa chỉ https://bitbucket.org/dalloliogm/vcf2networks

Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25282646

{fcomment}

LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.

ĐỌC THÊM:  SortMeRNA: Công cụ phát hiện rRNA trong dữ liệu transcriptome RNA-seq
ĐỌC THÊM:  So sánh một số công cụ lắp ráp de novo cho dữ liệu từ thiết bị giải trình tự thế hệ mới

Trả lời

Email của bạn sẽ không được hiển thị công khai. Các trường bắt buộc được đánh dấu *