Hệ gen vi khuẩn lao thu được từ bệnh phẩm tại bệnh viện Lao đã được giải trình tự bằng thiết bị đọc trình tự thế hệ mới Illumina Miseq. Từ dữ liệu trình tự hệ gen vi khuẩn lao đó, chúng tôi tiến hành so sánh với các hệ gen vi khuẩn lao đã được công bố trên ngân hàng gen thế giới và của viện nghiên cứu Broad và xác định được bản đồ đột biến SNP/Variant cho từng gen cụ thể.
Chúng tôi tiến hành phân tích Variant (INDEL/SNP) với hệ gen tham chiếu là W148, và kết quả thu được như sau
|
Tổng cộng |
4890 variant |
|
INDEL |
1896 |
|
SNP |
2994 |
|
Gene có nhiều Variant nhất |
17 |
Chi tiết mẫu phẩm, phương pháp, kết quả có tại So sánh genome vi khuẩn lao.pdf
LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.
