Xác định đột biến SNP/Variant của hệ gen vi khuẩn lao Việt Nam

Hệ gen vi khuẩn lao thu được từ bệnh phẩm tại bệnh viện Lao đã được giải trình tự bằng thiết bị đọc trình tự thế hệ mới Illumina Miseq. Từ dữ liệu trình tự hệ gen vi khuẩn lao đó, chúng tôi tiến hành so sánh với các hệ gen vi khuẩn lao đã được công bố trên ngân hàng gen thế giới và của viện nghiên cứu Broad và xác định được bản đồ đột biến SNP/Variant cho từng gen cụ thể. 

Chúng tôi tiến hành phân tích Variant (INDEL/SNP) với hệ gen tham chiếu là W148, và kết quả thu được như sau

Tổng cộng

4890 variant

INDEL

1896

SNP

2994

Gene có nhiều Variant nhất

17

Chi tiết mẫu phẩm, phương pháp, kết quả có tại So sánh genome vi khuẩn lao.pdf

Trả lời

Email của bạn sẽ không được hiển thị công khai.