Giới thiệu về hệ thống phân tích Galaxy

Galaxy là gì ?

Galaxy là hệ thống mở tích hợp các công cụ tin sinh hoạt động trên nền tảng web với giao diện đồ họa rất dễ dùng và mạnh mẽ.

Galaxy dùng để làm gì?

Hệ thống Galaxy hỗ trợ những nhà sinh học không có nhiều kinh nghiệm máy tính trong việc phân tích dữ liệu sinh học.

Các tính năng của hệ thống như sau:

• Cung cấp giao diện đồ họa tương tác: Hầu hết các phần mềm tin sinh hiện nay được thực hiện bằng các câu lệnh trên môi trường là hệ điều hành *NIX (Ubuntu, Debian, Fedora, Mac OS, …). Điều này gây khó khăn cho các nhà nghiên cứu sinh học vốn quen thuộc với môi trường Windows với hầu hết các thao tác bằng chuột. Galaxy cung cấp một giao diện web hoạt động trên hầu hết các trình duyệt phổ biến và rất đơn giản cho phép người dùng có thể cài đặt, nâng cấp và tùy chỉnh các phần mềm dễ dàng tùy theo nhu cầu sử dụng.
• Tích hợp và quản lý dữ liệu: Hệ thống Galaxy hỗ trợ tải lên dữ liệu từ máy tính cá nhân hoặc trực tiếp từ những CSDL công khai. Galaxy hỗ trợ nhiều định dạng dữ liệu sinh học và có thể chuyển đổi định dạng giữa chúng.
• Tạo và quản lý các quy trình phân tích: Trong thực tế, việc phân tích dữ liệu là quá trình tích hợp một cách khéo léo một chuỗi các phần mềm phân tích. Galaxy giúp người dùng tích hợp các công cụ thành quy trình phân tích (workflow) và thiết lập thông số mà không đòi hỏi kỹ năng về lập trình. Các quy trình phân tích này được Galaxy lưu lại và sẵn sàng cho việc phân tích sau này, điều này rất có ý nghĩa trong việc tiến hành thí nghiệm lặp lại.

LoBi sẽ làm gì với galaxy?

Hệ thống Galaxy do Phòng Tin sinh học, Viện Công nghệ sinh học (Lab of Bioinformatics – LoBi) xây dựng sẽ cung cấp các công cụ phân tích cơ bản miễn phí giúp cho các nhà sinh học có thể sử dụng một cách dễ dàng. Mặc dù hệ thống Galaxy trên máy chủ tính toán hiệu năng cao của Viện Công nghệ sinh học, nhưng sẽ bị quá tải nếu có quá nhiều người truy cập cùng lúc.

Hệ thống Galaxy của Lobi có thể được truy cập tại: http://galaxy.ibt.ac.vn