SortMeRNA: Công cụ phát hiện rRNA trong dữ liệu transcriptome RNA-seq

Mục tiêu: Việc áp dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS) vào các dự án RNA-seq đã đặt ra một bài toán khó giải cho các nhóm nghiên cứu rằng: tách chiết RNA tổng số có bị lẫn ribosomal RNA (rRNA) hay không? Sàng lọc được coding RNA và non-coding RNA là một bước phân tích quan trọng để tiếp tục những phân tích sâu hơn về biểu hiện trong các dự án RNA-seq

Kết quả: Phần mềm SortMeRNA đã ra đời dựa trên mục tiêu này nhằm loại bỏ các đoạn rRNA từ dữ liệu transcriptomic. Công cụ này có khả năng xử lý các tập trình tự đọc dung lượng lớn và cho kết quả rất nhạy trên cơ sở dữ liệu rRNA cũng như có thời gian chạy máy thấp.

Link:http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/28/24/3211

Trả lời

Email của bạn sẽ không được hiển thị công khai.