Genomic Selection là gì?

Genomic selection là phương pháp lai tạo sử dụng dữ liệu di truyền (genomic data) của một con vật để đưa ra quyết định lai tạo. Phương pháp này bao gồm việc xác định các markers hoặc variants liên quan đến các tính trạng mong muốn, chẳng hạn như khả...

Shotgun metagenomics: hiểu rõ về hệ vi sinh vật

Giới thiệu Các cộng đồng vi sinh vật là những hệ sinh thái phức tạp và đa dạng đóng vai trò quan trọng trong nhiều khía cạnh của cuộc sống, từ việc duy trì sức khỏe cho đến đẩy mạnh quá trình sinh hóa địa hóa trong môi trường. Việc...

Phân tích 16S metagenomics với MOTHUR

Mothur là một phần mềm Tin sinh học miễn phí và mã nguồn mở được sử dụng trong phân tích dữ liệu 16S metagenomics. Nó cung cấp một loạt các công cụ và chức năng để thực hiện các bước khác nhau trong việc phân tích dữ liệu 16S metagenomics,...

Phân tích metagenomics với QIIME

Quy trình phân tích QIIME QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology) là một pipeline Tin sinh học phổ biến để phân tích dữ liệu metagenomic. Đây là một phần mềm miễn phí và mã nguồn mở cung cấp một bộ công cụ toàn diện để thực hiện kiểm soát chất...

Pipeline phân tích 16S/ITS metagenomics phổ biến

Có nhiều pipeline được sử dụng để phân tích dữ liệu 16S/ITS metagenomics, tùy thuộc vào mục đích và tính năng của từng pipeline. Dưới đây là một số pipeline phổ biến được sử dụng nhiều trong phân tích 16S/ITS metagenomics: QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology): QIIME là một...

Best practices trong phân tích 16S/ITS metagenomics

Kiểm soát chất lượng dữ liệu đọc trình tự: Kiểm soát chất lượng là một bước cần thiết trong phân tích dữ liệu metagenomic 16S. Nó bao gồm lọc các read có chất lượng lượng thấp, loại bỏ các read có độ dài ngắn, cắt các chuỗi adapter và loại...

Những ứng dụng nổi trội của 16S amplicon sequencing?

16S amplicon sequencing là một công cụ quan trọng trong vi sinh học và đã được sử dụng rộng rãi trong nhiều lĩnh vực khác nhau. Sau đây là những ứng dụng nổi trội của metagenomic 16S: Nghiên cứu vi sinh vật đồng sinh: 16S amplicon sequencing được sử dụng...

Xu hướng nghiên cứu và ứng dụng 16S amplicon sequencing trong những năm qua?

Trong những năm gần đây, nghiên cứu và ứng dụng của 16S amplicon sequencing đã phát triển mạnh mẽ và có nhiều xu hướng như sau: Sự phát triển của công nghệ NGS (Next-Generation Sequencing) đã giúp tăng đáng kể độ phân giải và khả năng xác định các loài...

Metagenomics: Chọn V1V2 hay V3V4?

Sau khi đăng bài Phân tích metagenomics: 16S, 18S, ITS hay shotgun?, chúng tôi tiếp tục nhận được câu hỏi: Nên chọn V1V2 hay V3V4 cho nghiên cứu metagenomics? Như các bạn đã biết, 16S rRNA được sử dụng để phân tích đa dạng của các loài vi khuẩn hoặc...

Việt Nam và sự phát triển Tin Sinh học

Bioinformatics hay tin sinh học là một ngành khoa học quản lý và phân tích các dữ kiện sinh học trên máy tính. Khác biệt với cản trở tài chính làm cho việc thiết lập một phòng thí nghiệm sinh học hiện đại trở nên quá tốn kém, nhiều người...