Tổng quan về chú giải chức năng cho dữ liệu RNA-seq

Tính ứng dụng và tiện lợi từ việc tạo ra dữ liệu RNA-seq đã thúc đẩy những hướng nghiên cứu về chú giải chức năng trong những năm gần đây. Mặc dù vậy, những phân tích về RNA-seq mới chỉ đưa ra một danh sách gen riêng biệt (differentially expressed genes) chứ chưa thể giúp chúng ta hiểu rõ được danh sách gene biểu hiện này làm thay đổi kiểu hình của một loài như thế nào.

Ngày hôm nay tinsinhhoc.org xin giới thiệu với độc giả một mini-workshop của PGS Fiona McCarthy đến từ Đại học Arizona, Hoa Kỳ. Mục tiêu của workshop này nhằm thảo luận những công cụ nào đang được sử dụng để mô hình hóa các chức năng có trong dữ liệu RNA-seq, bao gồm cả các phân tích làm giàu GeneOntology và Pathway. Bên cạnh đó PGS Fiona cũng giới thiệu về phần mềm iPlant với những tiện ích được sử dụng trong phân tích chú giải chức năng của dữ liệu RNA-seq. Dữ liệu RNA-seq sử dụng trong buổi workshop là những dữ liệu thật và đã được công bố trên các tạp chí.

{fcomment}