MỤC LỤC BÀI VIẾT
Giới thiệu khóa học
- Khóa học BIC23: Phân tích Metagenomics: 16S và Shotgun tập trung cung cấp cho học viên cái nhìn tổng quan về phân tích dữ liệu metagenomics, đồng thời tạo điều kiện để học viên trực tiếp thực hành những pipeline cơ bản trong phân tích đa dạng vi sinh vật.
- BIC23 là sự cải tiến và tinh chỉnh từ các khóa BIC16, BIC21, có những thay đổi và cập nhật tích cực như: học viên đã có thể chạy phân tích trên mọi hệ điều hành và giao diện đồ họa thay vì sử dụng command line; các công cụ phân tích mới và thân thiện với người dùng được bổ sung như Mothur (ứng dụng phân tích 16S), metaPhIAN, metaSPADES (phân tích dữ liệu shotgun),…
- Giảng viên:
- TS. Trần Thị Thanh Tâm (Trường Đại học USTH)
- TS. Nguyễn Cường (Nguyên trưởng phòng Tin sinh học, Viện Công nghệ sinh học, VAST; Founder/CEO LOBI Vietnam).
Mục tiêu khóa học
Sau khóa học, học viên sẽ nắm rõ và tự mình thực hiện được các bước phân tích đa dạng mẫu vi sinh vật như:
- Hiểu được dữ liệu đọc trình tự gen thế hệ mới
- Đánh giá chất lượng dữ liệu giải trình tự thế hệ mới (NGS)
- Phân tích tin sinh đối với mẫu sử dụng 16S: Tinh sạch dữ liệu, phân nhóm, định danh vi khuẩn và ước tính chỉ số đa dạng alpha, beta.
- Phân tích tin sinh đối với mẫu sử dụng shotgun: định danh và tìm gen chức năng trên các gen chỉ thị, lắp ráp hệ gen de novo sử dụng dữ liệu shotgun metagenomics, chú giải gen chức năng từ hệ gen lắp ráp.
- Phân tích thống kê dữ liệu hệ vi sinh: trực quan hóa các chỉ số đa dạng và sự phong phú về loài; tính toán kiểm định thống kê thường dùng trong so sánh giữa các loài; diễn giải các kết quả trên.
Khóa học này dành cho ai?
- Các bạn sinh viên từ năm nhất chuyên ngành sinh học, công nghệ sinh học, …
- Thạc sĩ, Nghiên cứu sinh nhà nghiên cứu quan tâm tới lĩnh vực phân tích đa dạng vi sinh vật và xử lý dữ liệu tin sinh.
Yêu cầu đầu vào
- Kiến thức: Học viên cần có kiến thức căn bản về sinh học phân tử
- Trang thiết bị: Laptop có cấu hình trung bình (chip i3, RAM 8Gb)
Nội dung khóa học:
| STT | Nội dung giảng dạy | Thời gian |
| 1 | Giới thiệu giải trình tự 16S rRNA metagenomics | Ngày 1 |
| 2 | Thiết kế thí nghiệm | |
| 3 | Thực hành phần 1: Phân tích dữ liệu giải trình tự 16S metagenomics (Mothur) | |
| 4 | Giới thiệu giải trình tự shotgun metagenomics | Ngày 2 |
| 5 | Thực hành phần 2: Phân tích dữ liệu giải trình tự shotgun metagenomics (MetaPhlAn, Human2, MetaSPADES) | |
| 6 | Phân tích thống kê và trực quan hóa dữ liệu hệ vi sinh | |
| 7 | Q & A Tổng kết khóa học |
- Ngôn ngữ giảng dạy: Tiếng Việt.
Thời gian & Địa điểm:
- Khóa học diễn ra 2 ngày T7 và CN: 8-9/7/2023
- Địa điểm: 18 Hoàng Quốc Việt, Hà Nội
Học phí
| Học viên | Thời hạn đăng ký | Học phí | Ưu đãi |
| Đăng ký sớm | 20/02/2023 đến 28/04/2023 | 3,000,000 VND | Giảm 500K với học viên là sinh viên đại học (cần có mình chứng bằng thẻ sinh viên/giấy chứng nhận) |
| Đăng ký thường | 29/04/2023 đến 30/06/2023 | 5,000,000 VND |
Ghi chú:
- Đăng ký sớm được ghi nhận khi hoàn thành nộp học phí trong thời hạn
- Học phí đã bao gồm chi phí ăn trưa 2 ngày, tài liệu in ấn, tea break)
Cách thức đăng ký
- Học viên đăng ký theo Google form ở link: https://forms.gle/gjvkkZaAF3vZRj8Q7
- Liên hệ tới zalo/hotline: 092.510.8899 hoặc email: info@lobi.vn để được tư vấn và đăng ký ngay
- Hướng dẫn thanh toán học phí sẽ được gửi sau khi học viên hoàn tất đăng ký
- Do số lượng học viên tối đa là khoảng 36 người/khóa để đảm bảo chất lượng khóa học, đơn đăng ký có thể đóng trước hạn nếu chương trình đã nhận đủ học viên.
LOBI Vietnam là công ty tiên phong trong lĩnh vực Đọc trình tự gen thế hệ mới NGS (Next Generation Sequencing) và Phân tích Tin sinh học. Liên hệ hotline/Zalo 092.510.8899 để biết thêm chi tiết.
