Microbiome mô phỏng chiến trường: Mô hình Bayes tạo nên ‘thế giới vi sinh ảo’ phục vụ nghiên cứu quân sự

Mở đầu: Khi hệ vi sinh vật trở thành một ‘đồng đội’ chiến lược Trong thế kỷ 21, khi chiến tranh không còn chỉ là cuộc đấu súng mà còn là cuộc chiến chống lại stress, thời tiết khắc nghiệt, và cả những vi khuẩn lạ từ môi trường, một...

Mối quan hệ ruột gan: Vai trò của giải trình tự amplicon 16S rRNA toàn chiều dài trên hệ sinh vật đường ruột trong cuộc chiến với ung thư gan

Ung thư gan là một trong những nguyên nhân hàng đầu gây tử vong do ung thư trên toàn thế giới, với tỷ lệ mắc và tử vong đặc biệt cao ở các quốc gia Đông Á và Đông Nam Á. Bên cạnh các yếu tố nguy cơ đã biết...

Thuật toán chuẩn cho trình tự Amplicon 16S rRNA

Phân tích đánh giá toàn diện và không thiên vị về tám thuật toán xử lý dữ liệu trình tự 16S rRNA amplicon, bao gồm cả các phương pháp dựa trên Đơn vị Phân loại Thực nghiệm (OTUs) và Biến thể Chuỗi Amplicon (ASVs). Các nhà nghiên cứu đã sử...

Có cần một giao thức phân tích trình tự khuếch đại gen 16S rRNA chuẩn hóa cho nghiên cứu hệ vi sinh vật gia cầm không?

  Giới thiệu Hệ vi khuẩn đường tiêu hóa (GIT) là thành phần chính trong sức khỏe, dinh dưỡng, điều hòa sinh lý, phát triển ruột và tăng trưởng của gia cầm. Trong hai thập kỷ qua, việc phát triển và chi phí thấp hơn của công nghệ giải trình...

Đánh giá trình tự gen 16S rRNA để phân tích hệ vi sinh vật ở cấp độ loài và chủng

Tổng quan và Đặt vấn đề • Gen 16S rRNA từ lâu đã là công cụ chính để phân tích vi khuẩn dựa trên trình tự gen. • Tuy nhiên, các kỹ thuật giải trình tự thông lượng cao trước đây (như Illumina) chỉ tạo ra các đoạn đọc ngắn,...

So sánh các quy trình tin sinh học và hệ điều hành trong phân tích trình tự amplicon gen 16S rRNA từ mẫu phân người

TÓM TẮT Giải trình tự amplicon gen ribosome RNA 16S (16S rRNA) bằng công nghệ giải trình tự thông lượng cao (HTS) hiện đang là phương pháp phổ biến nhất để khảo sát cộng đồng vi sinh vật đường ruột phức tạp. Tuy nhiên, kết quả nhận diện vi khuẩn...

So sánh hiệu quả của đoạn đọc 16S rRNA ngắn và dài trong phân tích quần xã vi sinh vật dạ cỏ bò thông qua các nền tảng giải trình tự Illumina MiSeq và Pacific Biosciences RSII

Tóm tắt Công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS) đã cách mạng hóa phương pháp phân tích gen 16S rRNA trong các nghiên cứu sinh thái vi sinh vật. Hiện có ba công nghệ chủ đạo cho việc giải trình tự 16S quy mô lớn, mỗi công nghệ...

Đánh giá hiệu năng giải trình tự khuếch đại gen 16S rRNA sử dụng dữ liệu hệ vi sinh vật đường ruột của người Nhật với các bộ mồi V1–V2 và V3–V4

Tổng quan và Đặt vấn đề Phân tích trình tự gen 16S rRNA (phân tích 16S) được sử dụng rộng rãi để phân tích hệ vi sinh vật bằng công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS). Tuy nhiên, vẫn chưa có một phương pháp chuẩn vàng nào được...

PCVR: Một Biểu diễn Thị giác Theo ngữ cảnh Được Huấn luyện Trước để Phân loại Trình tự DNA

Mở đầu Việc phân loại trình tự DNA là một nhiệm vụ cực kỳ quan trọng trong tin sinh học, đóng vai trò thiết yếu trong việc hiểu và xác định sự khác biệt di truyền giữa các loài khác nhau. Điều này thúc đẩy nghiên cứu và bảo tồn...

Giải Mã Bí Mật Của Siêu Vi Khuẩn: Trí Tuệ Nhân Tạo Giúp Chúng Ta Hiểu Rõ Hơn Về Salmonella Kháng Thuốc

Kháng kháng sinh (AMR) là một trong những mối đe dọa sức khỏe cộng đồng toàn cầu cấp bách nhất của thế kỷ 21. Vi khuẩn, virus, nấm và ký sinh trùng theo thời gian không còn phản ứng với thuốc, khiến các bệnh nhiễm trùng thông thường trở nên...