Pipeline phân tích 16S/ITS metagenomics phổ biến

Có nhiều pipeline được sử dụng để phân tích dữ liệu 16S/ITS metagenomics, tùy thuộc vào mục đích và tính năng của từng pipeline. Dưới đây là một số pipeline phổ biến được sử dụng nhiều trong phân tích 16S/ITS metagenomics: QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology): QIIME là một...

Best practices trong phân tích 16S/ITS metagenomics

Kiểm soát chất lượng dữ liệu đọc trình tự: Kiểm soát chất lượng là một bước cần thiết trong phân tích dữ liệu metagenomic 16S. Nó bao gồm lọc các read có chất lượng lượng thấp, loại bỏ các read có độ dài ngắn, cắt các chuỗi adapter và loại...

Những ứng dụng nổi trội của 16S amplicon sequencing?

16S amplicon sequencing là một công cụ quan trọng trong vi sinh học và đã được sử dụng rộng rãi trong nhiều lĩnh vực khác nhau. Sau đây là những ứng dụng nổi trội của metagenomic 16S: Nghiên cứu vi sinh vật đồng sinh: 16S amplicon sequencing được sử dụng...

Xu hướng nghiên cứu và ứng dụng 16S amplicon sequencing trong những năm qua?

Trong những năm gần đây, nghiên cứu và ứng dụng của 16S amplicon sequencing đã phát triển mạnh mẽ và có nhiều xu hướng như sau: Sự phát triển của công nghệ NGS (Next-Generation Sequencing) đã giúp tăng đáng kể độ phân giải và khả năng xác định các loài...

16S amplicon sequencing là gì?

16S amplicon sequencing còn được gọi là Metagenomic 16S, 16S rRNA gene sequencing hoặc 16S ribosomal RNA sequencing. Nó là một phương pháp phổ biến trong việc phân tích đa dạng vi khuẩn trong các mẫu sinh thái học bằng cách phân tích các đoạn gen 16S rRNA có mặt...

BIC23: Khóa học Phân tích Metagenomics: 16S và Shotgun

Giới thiệu khóa học Khóa học BIC23: Phân tích Metagenomics: 16S và Shotgun tập trung cung cấp cho học viên cái nhìn tổng quan về phân tích dữ liệu metagenomics, đồng thời tạo điều kiện để học viên trực tiếp thực hành những pipeline cơ bản trong phân tích đa...

Khóa học: Metagenomics từ A tới Z

1. Thời gian đào tạo Khóa học diễn ra trong 5 ngày với 10 buổi học. Buổi sáng học từ 8h-12h, buổi chiều học từ 13h-17h Khóa học dự kiến khai giảng trong tháng 8 hoặc 9/2022. Ngày khai giảng sẽ được thông báo tới các học viên, trên cơ...

LOBI tuyển thực tập sinh

LOBI Việt Nam tuyển thực tập sinh Quyền lợi của thực tập sinh Được đào tạo kiến thức chuyên ngành Tin sinh học Được tham gia các dự án phân tích dữ liệu khác nhau, dự án đào tạo, dự án nghiên cứu Rèn luyện kỹ năng nghiên cứu độc...

Metagenomics: Chọn V1V2 hay V3V4?

Sau khi đăng bài Phân tích metagenomics: 16S, 18S, ITS hay shotgun?, chúng tôi tiếp tục nhận được câu hỏi: Nên chọn V1V2 hay V3V4 cho nghiên cứu metagenomics? Như các bạn đã biết, 16S rRNA được sử dụng để phân tích đa dạng của các loài vi khuẩn hoặc...

Liệu pháp Dronabinol và Kiểu gen CYP2C9

Giới thiệu Dronabinol (thương hiệu Marinol, Syndros) được chiết suất từ cần sa và tác động lên hệ thần kinh. Dronabinol được sử dụng trong điều trị buồn nôn và nôn do hóa trị liệu (CINV) ở những người không đáp ứng với liệu pháp chống nôn thông thường và...