RiceVarMap – Cơ sở dữ liệu toàn diện về biến thể gen lúa

RiceVarMap (Rice Variation Map, http://ricevarmap.ncpgr.cn) là một cơ sở dữ liệu về các thay đổi trong hệ gen của lúa. Cơ sở dữ liệu cung cấp thông tin toàn diện về 6.551.358 đột biến đơn điểm (SNP), 1.214.627 INDEL (insertions/deletions) trong trình tự của 1479 giống lúa. Tất cả các...

Dữ liệu Rna-seq: Thách thức và những gợi ý cho thiết kế thí nghiệm và phân tích

RNA-seq dường như đã trở thành phương pháp rất phổ biến trong phân tích biểu hiện gen cũng như phát hiện những transcript mới, xác định biểu hiện trên alen đặc hiệu hay có thể ước lượng chính xác sự dịch mã của transcript. Thiết kế thí nghiệm chặt chẽ...

Lựa chọn marker cho các nghiên cứu về di truyền

Việc kết hợp các nghiên cứu có thể chú trọng đến các gen tiềm năng, một vùng di truyền cụ thể hay toàn bộ hệ gen… chúng đều có ý nghĩa trong việc lựa chọn marker. Lựa chọn marker cơ chiến lược sẽ có ảnh hưởng lớn đến các nghiên...

Phân tích hệ phiên mã cơ xương của người

Cơ xương của chúng ta có ảnh hưởng trực tiếp đến rất nhiều bệnh như tiểu đường tuýp 2, bệnh tim và cả ung thư. Cơ xương là một trong nhưng mô được sử dụng rộng rãi nhất để nghiên cứu những cơ chế gây bệnh khác nhau. Với những...

Cải thiện khả năng dự đoán gen trên hệ gen chuột bằng cách kết hợp EST với thông tin trình tự RNA

Tác giả: Li L1, Chen E2, Yang C3, Zhu J4, Jayaraman P5, De Pons J5, Kaczorowski CC3, Jacob HJ6, Greene A3, Hodges MR3, Cowley AW Jr3, Liang M3, Xu H7, Liu P8, Lu Y9. RNA–seq (còn gọi là trình tự transcriptome) là một công nghệ đang phát triển sử dụng...

“Gene thông minh” chưa hẳn đã thông minh

Việc các nhà khoa học đang tìm kiếm những gene có ảnh hưởng đến trí tuệ trên thực tế rất gian nan. Một trong những nghiên cứu lớn và nghiêm túc nhất về cơ sở di truyền của trí tuệ loài người cũng mới chỉ đưa ra được một vài...

Giải trình tự và phân tích gen lợn Mangalica – giống lợn béo đặc trưng ở Hungary

Tác giả: Molnár J, Nagy T, Stéger V, Tóth G, Marincs F1, Barta E. Mangalicas là loài lợn béo và quý hiếm đặc trưng của Hungary. Để hiểu rõ đặc tính di truyền, chúng tôi chọn ra từ mỗi giống lợn Mangalica một con lợn đực (lợn Mangalica có ba...

RNA-Rocket: Nguồn tài nguyên cho phân tích RNA-seq trong nghiên cứu bệnh lây nhiễm

RNA-seq là phương pháp sàng lọc hệ phiên mã sử dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới và là một trong những nhân tố quan trọng trong rất nhiều dự án nghiên cứu mong muốn khám phá các transcripts isoform, sàng lọc biểu hiện hay cấu trúc phiên...

Tích hợp các biến đổi di truyền phổ biến và biến đổi di truyền hiếm ở các nhóm người khác nhau

Mặc dù đã có những tiến bộ lớn trong việc xác định các biến đổi di truyền ảnh hưởng đến bệnh ở người, tuy nhiên, hầu hết bệnh liên quan đến di truyền vẫn chưa thể giải thích. Cần phải thực hiện những nghiên cứu trên toàn bộ hệ gen...

Phân tích phát sinh loài và so sánh trình tự của vi khuẩn sinh Alpha Amylase bền nhiệt thuộc các giới Archea, Prokaryotes và Eukaryotes

Tác giả: Huma T1, Maryam A1, Rehman SU2, Qamar MT1, Shaheen T1, Haque A1, Shaheen B1 Alpha amylase nói chung được định nghĩa là nhóm enzyme có khả năng thủy phân liên kết alpha của các polysaccharide. Để phân tích và so sánh các nhóm alpha amylase, trình tự nucleotide...