Hoàn thành giải trình tự hệ gen táo tàu

Trường Đại học Nông nghiệp Hà Bắc cùng BGI Tech đã công bố trình tự hệ gen cây táo tàu. Táo tàu là loài đóng vai trò quan trọng nhất về mặt kinh tế trong những cây họ Táo và việc giải trình tự của loài này đặc biệt khó...

Phát hiện virus thực vật trong tự nhiên nhờ RNA-seq

Giải trình tự RNA bằng các máy giải trình tự thế hệ mới đang là bước làm đột phá trong nghiên cứu virus. Bên cạnh việc phát hiện rất nhiều chủng virus có trong các cậy dại ở môi trường tự nhiên, RNA-seq cũng cho phép thu thập cả dữ...

VCF2Networks: Ứng dụng phân tích mạng lưới kiểu gen sử dụng SNP

Hiện nay với nhiều dự án giải trình tự toàn bộ hệ gen đã mở ra những phương hướng nghiên cứu về mối liên kết giữa kiểu gen và kiểu hình. Một trong những hướng nghiên cứu đó là phân tích mạng lưới kiểu gen sử dụng dữ liệu di...

RiceVarMap – Cơ sở dữ liệu toàn diện về biến thể gen lúa

RiceVarMap (Rice Variation Map, http://ricevarmap.ncpgr.cn) là một cơ sở dữ liệu về các thay đổi trong hệ gen của lúa. Cơ sở dữ liệu cung cấp thông tin toàn diện về 6.551.358 đột biến đơn điểm (SNP), 1.214.627 INDEL (insertions/deletions) trong trình tự của 1479 giống lúa. Tất cả các...

Dữ liệu Rna-seq: Thách thức và những gợi ý cho thiết kế thí nghiệm và phân tích

RNA-seq dường như đã trở thành phương pháp rất phổ biến trong phân tích biểu hiện gen cũng như phát hiện những transcript mới, xác định biểu hiện trên alen đặc hiệu hay có thể ước lượng chính xác sự dịch mã của transcript. Thiết kế thí nghiệm chặt chẽ...

Lựa chọn marker cho các nghiên cứu về di truyền

Việc kết hợp các nghiên cứu có thể chú trọng đến các gen tiềm năng, một vùng di truyền cụ thể hay toàn bộ hệ gen… chúng đều có ý nghĩa trong việc lựa chọn marker. Lựa chọn marker cơ chiến lược sẽ có ảnh hưởng lớn đến các nghiên...

Phân tích hệ phiên mã cơ xương của người

Cơ xương của chúng ta có ảnh hưởng trực tiếp đến rất nhiều bệnh như tiểu đường tuýp 2, bệnh tim và cả ung thư. Cơ xương là một trong nhưng mô được sử dụng rộng rãi nhất để nghiên cứu những cơ chế gây bệnh khác nhau. Với những...

Cải thiện khả năng dự đoán gen trên hệ gen chuột bằng cách kết hợp EST với thông tin trình tự RNA

Tác giả: Li L1, Chen E2, Yang C3, Zhu J4, Jayaraman P5, De Pons J5, Kaczorowski CC3, Jacob HJ6, Greene A3, Hodges MR3, Cowley AW Jr3, Liang M3, Xu H7, Liu P8, Lu Y9. RNA–seq (còn gọi là trình tự transcriptome) là một công nghệ đang phát triển sử dụng...

“Gene thông minh” chưa hẳn đã thông minh

Việc các nhà khoa học đang tìm kiếm những gene có ảnh hưởng đến trí tuệ trên thực tế rất gian nan. Một trong những nghiên cứu lớn và nghiêm túc nhất về cơ sở di truyền của trí tuệ loài người cũng mới chỉ đưa ra được một vài...

Giải trình tự và phân tích gen lợn Mangalica – giống lợn béo đặc trưng ở Hungary

Tác giả: Molnár J, Nagy T, Stéger V, Tóth G, Marincs F1, Barta E. Mangalicas là loài lợn béo và quý hiếm đặc trưng của Hungary. Để hiểu rõ đặc tính di truyền, chúng tôi chọn ra từ mỗi giống lợn Mangalica một con lợn đực (lợn Mangalica có ba...