Metavir 2: công cụ mới nhằm so sánh nhiều hệ gen virus và phân tích hệ gen virus đã được lắp ráp

Metavir 2: new tools for viral metagenome comparison and assembled virome analysis Simon Roux, Jeremy Tournayre, Antoine Mahul, Didier Debroas và François Enault* Bối cảnh Metagenomic là phương pháp thích hợp giúp chúng ta có cái nhìn sâu hơn về cấu trúc và chức của các quần thể virus trong...

Giải trình tự thế hệ mới phải bị loại bỏ (phần 1)

Tôi thực sự ghét thuật ngữ “giải trình tự thế hệ mới” (next-generation sequencing -NGS). Và đây là lý do vì sao…   Công bố đầu tiên trên thế giới sử dụng thuật ngữ này (theo như những gì tôi tìm) là từ một bài báo trên tạp chí Drug...

Nghiên cứu kết hợp toàn bộ hệ gen và dự đoán di truyền các tính trạng liên quan đến chỉ số khối lượng cơ thể

Genome-Wide Association Studies and Heritability Estimates of Body Mass Index Related Phenotypes in Bangladeshi Adults Authors: Molly Scannell Bryan, Maria Argos, Brandon Pierce, Lin Tong, Muhammad Rakibuz-Zaman, Alauddin Ahmed, Mahfuzar Rahman, Tariqul Islam, Muhammad Yunus, Faruque Parvez, Shantanu Roy, Farzana Jasmine, John A. Baron, [ … ], Habibul Ahsan Tóm tắt: Khối lượng cơ thể cũng như...

Thông tin mới giúp tìm ra enzyme lignin từ nghiên cứu ruột Mối

Một nhóm nhà khoa học đã nghiên cứu hệ tiêu hóa và hệ vi sinh vật sống trong ruột Mối. Họ đã phát phát hiện các bằng chứng mà cho phép họ có thể theo dõi những gen có liên quan đến sự phân hủy của lignin, Lignin là thành...

Xác định enzyme hoạt hóa carbohydrate bằng phương pháp phân tích metagenomics mẫu trầm tích dưới biển

Carbohydrate-active enzymes identified by metagenomic analysis of deep-sea sediment bacteria Author: Klippel B1, Sahm K, Basner A, Wiebusch S, John P, Lorenz U, Peters A, Abe F, Takahashi K, Kaiser O, Goesmann A, Jaenicke S, Grote R, Horikoshi K, Antranikian G. Mẫu được lấy từ một lõi trầm tích có...

Đánh giá chất lượng lắp ráp hệ phiên mã: những điểm mới và cũ.

Assessing De Novo transcriptome assembly metrics for consistency and utility O’Neil ST1, Emrich SJ. Bối cảnh: Giải trình tự và lắp ráp hệ phiên mã đánh dấu một bước đột phá đem lại lượng tài nguyên dữ liệu rất lớn cho nghiên cứu những loài không phải là loài kiểu...

Phân tích metagenomics dạ cỏ Trâu Ấn Độ – Nguồn tiềm năng lớn cho việc tìm ra các enzyme phân giải sinh khối

High Potential Source for Biomass Degradation Enzyme Discovery and Environmental Aspects Revealed through Metagenomics of Indian Buffalo Rumen Singh KM1, Reddy B2, Patel D2, Patel AK2, Parmar N2, Patel A2, Patel JB3, Joshi CG2 Ý tưởng bài báo cho rằng: Quần thể vi sinh vật tồn tại trong dạ cỏ...

Đánh giá tính khả dụng lâm sàng của dữ liệu genomic và proteomic thu được từ các khối u

Assessing the clinical utility of cancer genomic and proteomic data across tumor types Author: Yuan Yuan, Eliezer M Van Allen, Larsson Omberg, Nikhil Wagle, Ali Amin-Mansour, Artem Sokolov, Lauren A Byers, Yanxun Xu, Kenneth R Hess, Lixia Diao, Leng Han, Xuelin Huang, Michael S Lawrence, John N Weinstein, Josh M...

SAT-Assembler: Bộ công cụ phân tích mở rộng và xác định chính xác mục tiêu cho dữ liệu máy giải trình tự thế hệ mới

Lắp ráp trình tự gen, nhằm ráp lại các đoạn trình tự ngắn hơn lại, là một trong những bước quan trọng trong việc phân tích dữ liệu của máy giải trình tự thế hệ mới. Thiếu bộ gen tham khảo có chất lượng, phân tích De novo sẽ là...

Giải trình tự hoàn thiện lục lạp của 5 loài Araliaceae

Tác giả: Rong Li, Peng-Fei Ma, Jun Wen mail, Ting-Shuang Yi Bối cảnh: Họ Sâm (Araliaceae) có nhiều loài có ý nghĩa kinh tế rất quan trọng. Những nghiên cứu phân loại tiến hóa trước đây xoay quanh ba nhánh chính trong họ Sâm, nhưng mối quan hệ giữa các loài...