Giải trình tự phác thảo bộ gene (Draft genome sequence) của Mycobacterium neoaurum dòng DSM 44074T
Mycobacterium neoaurum là một loài vi khuẩn ngoài môi trường và sinh trưởng nhanh thuộc chi Mycobacterium. Có một số ghi chép về chúng là nguyên nhân gây bệnh khi nhiễm vào máu, da, phổi ở những bệnh nhân bị suy giảm hệ thống miễn dịch. Để hoàn thiện bộ...
Tổng hợp: Các tài nguyên tin sinh học sử dụng trong nghiên cứu SNP
SNP bioinformatics: a comprehensive review of resources Author: Andrew D. Johnson Giới thiệu: Những năm gần đây chứng kiến sự tăng lên theo hàm mũ của các nghiên cứu và phát hiện mới về genetic và genomic variation do ngày càng có nhiều genome được giải trình tự hoàn chỉnh, đi...
EBI metagenomic một giải pháp cho lưu trữ và phân tích dữ liệu metagenomic
Metagenomic là lĩnh vực sử dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới được dùng để đánh giá đặc điểm của quần thể vi sinh vật ở các hệ sinh thái khác nhau như biển, hồ, đất, trong cơ thể người vv. Tuy nhiên ứng dụng metagenomic cũng gặp...
Các nhà nghiên cứu thành lập bộ tiêu chuẩn về kiểu gene của con người đối với việc giải trình tự hệ gene
Hướng dẫn bởi kỹ sư y sinh Justin Zook của viện tiêu chuẩn và công nghệ (National Institute of Standards and Technology) , một nhóm các nhà khoa học từ đại học Harvard và viện tin sinh học Virginia (Virginia Bioinformatics Institute of Virginia Tech) giới thiệu một số phương...
Skewer: Công cụ cắt adapter nhanh và chính xác cho dữ liệu pair-end giải trình tự thế hệ mới
Skewer: a fast and accurate adapter trimmer for next-generation sequencing paired-end reads. Jiang H1, Lei R, Ding SW, Zhu S Bối cảnh: Cắt adapter là bước đầu tiên và rất quan trọng trong xử lý dữ liệu giải trình tự thế hệ mới với độ dài trình tự đọc (reads)...
Nghiên cứu hệ gen của lợn bằng Quick SNP
Với sự phát triển nhanh chóng của công nghệ trong những năm gần đây, con người có thể tác động đến genome lợn ở mức độ base pair. Những hiểu biết này dễ dẫn đến quan niệm rằng những con lợn trên thế giới giống hệt nhau nếu có cùng...
Liệu chúng ta có thể dùng vi sinh vật thay thế cho các tế bào T và cytokine trong điều trị bệnh viêm đường ruột
Một điều rõ ràng rằng vi khuẩn đường ruột (có liên quan) đến nhiều khía cạnh của bệnh viêm đường ruột (IBD) và nhờ vào việc hiểu thêm về nguyên nhân từ vi khuẩn đó dẫn đến bệnh có thể hé mở ra những cơ hội mới để có thể...
Xét nghiệm gen cho bệnh tim
Đại học Y khoa Washington ở St Louis vừa đưa ra một xét nghiệm di truyền giúp chẩn đoán và điều trị bệnh nhân bị rối loạn tim mạch có thể dẫn đến đột tử. Xét nghiệm mới này – được cung cấp bởi trường Dịch Vụ Di Truyền và...
Metagenomics – Đây liệu đã là điểm dừng?
METAGENOMICS Đây liệu đã là điểm dừng? Trong sinh học, 3 stop codon được cho rằng kết thúc sự dịch mã là TAG (còn gọi là amber), TGA (còn gọi là opal) và TAA (còn gọi là ochre). Trong một nghiên cứu, Ivanova và các đồng tác giả đã phân...
Tổng hợp các công cụ Tin Sinh học dùng trong phân tích metagenomics
Khác với dữ liệu genome, dữ liệu metagenome thu được từ công nghệ giải trình tự thế hệ mới lớn hơn, có độ bao phủ thấp hơn và thường không dư thừa thông tin, dẫn đến thời gian phân tích và tỉ lệ lỗi cao hơn nếu sử dụng các...
