Metagenomics – Đây liệu đã là điểm dừng?

METAGENOMICS Đây liệu đã là điểm dừng? Trong sinh học, 3 stop codon được cho rằng kết thúc sự dịch mã là TAG (còn gọi là amber), TGA (còn gọi là opal) và TAA (còn gọi là ochre). Trong một nghiên cứu, Ivanova và các đồng tác giả đã phân...

Tổng hợp các công cụ Tin Sinh học dùng trong phân tích metagenomics

Khác với dữ liệu genome, dữ liệu metagenome thu được từ công nghệ giải trình tự thế hệ mới lớn hơn, có độ bao phủ thấp hơn và thường không dư thừa thông tin, dẫn đến thời gian phân tích và tỉ lệ lỗi cao hơn nếu sử dụng các...

PhyloSift: Phân tích phát sinh loài từ dữ liệu genomic và metagenomic

PhyloSift: Phân tích phát sinh loài từ dữ liệu genomic và metagenomic Author: Aaron E. Darling, Guillaume Jospin, Eric Lowe,Frederick A. Matsen, Holly M. Bik, and Jonathan A. Eisen. Giống như những sinh vật khác, vi sinh vật trong môi trường cũng có những tác động đến quá trình tiến...

Epigenome: DNA Không Là Định Mệnh

Y khoa cũng như khoa học nói chung càng ngày càng đem đến những chuyện khó tin nhưng có thật. Hai khoa học gia Michael Meaney và Moshe Szyf của McGill University, Canada nghiên cứu về tác dụng của sự triù mến của con chuột mẹ trên tương lai con...

So Sánh Các Phương Pháp Phân Loại Trình Tự 16S rRNA Thành OTU

A Comparison Of Methods For Clustering 16S rRNA Sequences Into Otus Wei Chen, Clarence K. Zhang, Yongmei Cheng, Shaowu Zhang, Hongyu Zhao mail Tóm tắt Các nghiên cứu gần đây về 16S rRNA ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới đã giúp chúng ta hiểu sâu hơn...

Đánh giá sự đa dạng và phân cụm 16S rRNA metagome sử dụng locality sensitive hashing

16S Rrna Metagenome Clustering And Diversity Estimation Using Locality Sensitive Hashing Zeehasham Rasheed*, Huzefa Rangwala* and Daniel Barbará Tóm tắt Tổng quan: Những tiến bộ trong công nghệ sinh học đã làm thay đổi phương pháp xác định những đặc điểm một số lượng lớn các loài trong quần thể...

Xác định SNP từ hệ phiên mã bóng bơi của cá nóc Takifugu rubripes

SNP discovery from transcriptome of the swimbladder of Takifugu rubripes Cui J1, Wang H1, Liu S2, Zhu L3, Qiu X1, Jiang Z1, Wang X1, Liu Z2     Tóm lược: Đa hình đơn nucleotide (SNP) đã trở thành một dấu chuẩn quan trọng trong các nghiên cứu ở quy mô...

MP3 – công cụ dự đoán protein gây bệnh từ dữ liệu genomic và metagenomic

MP3: A Software Tool for the Prediction of Pathogenic Proteins in Genomic and Metagenomic Data. Author: Gupta A, Kapil R, Dhakan DB, Sharma VK Xác định các protein có hại từ các bộ trình tự de novo rất hữu ích cho việc dự đoán và tìm hiểu cơ chế gây...

So sánh hai công cụ phân tích dữ liệu metagenomic: MR-RAST và QIIME

Trong những năm gần đây, thiết bị giải trình tự thế hệ mới (NGS) cùng với sự phát triển của phương pháp metagenomic đã cách mạng hóa lĩnh vực nghiên cứu hệ sinh thái vi sinh vật. Lượng dữ liệu metagenomic được tạo ra ngày càng lớn kéo theo sự...

Tuyển thực tập sinh

Phòng Tin sinh học, Viện Công nghệ sinh học, Viện Hàn Lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam THÔNG BÁO TUYỂN THỰC TẬP SINH Phòng Tin sinh học (LoBi), viện Công nghệ sinh học hiện luôn tuyển sinh viên thực tập tham gia các dự án Tin sinh học do phòng...