Blog

COSMIC: Cơ sở dữ liệu về các biến thể soma và dữ liệu lâm sàng về ung thư

COSMIC: Cơ sở dữ liệu về các biến thể soma và dữ liệu lâm sàng về ung thư Trong bối cảnh phức tạp của nghiên cứu ung thư, việc giải mã những thay đổi di truyền đóng vai trò then chốt trong việc hiểu rõ nguyên nhân, sự phát triển...

Flye và Xử Lý Dữ Liệu Từ Oxford Nanopore

Giới thiệu về Flye Flye là một phần mềm lắp ráp bộ gen de novo được thiết kế đặc biệt cho dữ liệu trình tự dài, chẳng hạn như dữ liệu từ công nghệ Oxford Nanopore. Công cụ này hoạt động dựa trên đồ thị de Bruijn và thuật toán...

RNA-seq Đọc Dài: Cánh Cửa Mở Ra Một Chương Mới Trong Chú Thích Genome

RNA-seq Đọc Dài: Cánh Cửa Mở Ra Một Chương Mới Trong Chú Thích Genome Giới thiệu RNA-seq (RNA sequencing) đã trở thành một công cụ không thể thiếu trong nghiên cứu sinh học phân tử, đặc biệt trong việc phân tích transcriptome. Trong khi phương pháp RNA-seq đọc ngắn đã...

Một số công cụ tin sinh (tools) phân tích hệ vi sinh vật

Phân tích hệ vi sinh vật (microbiome) đã trở thành một lĩnh vực nghiên cứu quan trọng nhờ sự phát triển của các phương pháp và công cụ hiện đại. Bài viết dưới đây sẽ đưa ra một số phương pháp được sử dụng phổ biến trong nghiên cứu. Phân...

Các yếu tố di truyền di động (MGEs)

Các yếu tố di truyền di động (MGEs) Giới thiệu Trong thế giới vi khuẩn, sự tiến hóa không chỉ là đến từ sự đột biến và chọn lọc tự nhiên mà còn có thể do các yếu tố di truyền động (MGEs). Các yếu tố này đóng vai trò...

Sự khác biệt giữa hệ gen của chủng E. coli gây bệnh và không gây bệnh

Hệ gen của Escherichia coli (E. coli) gây bệnh và không gây bệnh có nhiều điểm khác biệt quan trọng, chủ yếu liên quan đến sự hiện diện của các gen mã hóa yếu tố độc lực, vùng DNA đặc hiệu (pathogenicity islands – PAIs) và kích thước hệ gen....

K-mer: Công cụ mạnh mẽ trong phân tích dữ liệu sinh học

Giới thiệu về k-mer Trong kỷ nguyên mới với sự phát triển mạnh mẽ của sinh học phân tử và tin sinh học, việc phân tích dữ liệu lớn đòi hỏi các thuật toán hiệu quả để trích xuất thông tin có ý nghĩa. Trong đó, k-mer nổi lên như...

Tầm quan trọng của gen CYP2D6 trong chuyển hóa thuốc

Gen CYP2D6 (Cytochrome P450 Family 2 Subfamily D Member 6) mã hóa một enzyme thuộc họ cytochrome P450, đóng vai trò quan trọng trong quá trình chuyển hóa thuốc tại gan. Enzyme này tham gia vào việc oxy hóa nhiều loại thuốc và hợp chất ngoại sinh. Gen nằm trên...

Dùng ChatGPT để tìm kiếm trên NCBI

Hẳn những ai làm tin sinh học cũng không xa lạ gì với NCBI nhưng bạn có bao giờ tự hỏi liệu ChatGPT có thể tra được thông tin trên NCBI? Và NCBI đã tạo ra GeneGPT để phục vụ cho bạn hiện tại đã có custom version trên ChatGPT...

Đột biến trốn thoát?

Đột biến trốn thoát là gì? Trong tiếng anh có vô số từ để mô tả về đột biến này như: Antigenic escape, immune escape, immune evasion, escape mutation… Đây là một hành vi tiến hóa của virus giúp né tránh sự phát hiện của hệ miễn dịch vật chủ, các bộ kit-test...