Pipeline phân tích 16S/ITS metagenomics phổ biến

Có nhiều pipeline được sử dụng để phân tích dữ liệu 16S/ITS metagenomics, tùy thuộc vào mục đích và tính năng của từng pipeline. Dưới đây là một số pipeline phổ biến được sử dụng nhiều trong phân tích 16S/ITS metagenomics: QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology): QIIME là một...

Metagenomics: Chọn V1V2 hay V3V4?

Sau khi đăng bài Phân tích metagenomics: 16S, 18S, ITS hay shotgun?, chúng tôi tiếp tục nhận được câu hỏi: Nên chọn V1V2 hay V3V4 cho nghiên cứu metagenomics? Như các bạn đã biết, 16S rRNA được sử dụng để phân tích đa dạng của các loài vi khuẩn hoặc...