Thông báo Tuyển thực tập sinh

Hiện nay, phòng Tin sinh học đang có nhu cầu tuyển thực tập sinh tham gia dự án xây dựng bản đồ hệ gen. Các thực tập sinh sẽ được đào tạo, hướng dẫn và thực tập các công nghệ giải trình tự gen thế hệ mới (Next Generation Sequencing),...

Lắp ráp Contig (contig assembly)

Một contig là một đoạn trình tự liên tục có được từ việc lắp ráp các đoạn read có vùng trùng lặp với nhau, các đoạn read này được tạo ra khi sử dụng phương pháp giải trình tự từ dưới lên (bottom-up). Với phương pháp giài trình tự từ...

Lập bản đồ genome

Với sự phát triển nhanh chóng của kỹ thuật giải trình tự, chi phí giải trình tự gen giảm rất nhanh trong những năm tử 2008 đến 2012. Chi phí để giải mã 1Mb và Genome giảm tương ứng là 100,000 và 10,000 lần (Kris Wetterstrand, DNA Sequencing Costs, http://www.genome.gov/sequencingcosts/...

Phát triển thành công quy trình lắp ráp bộ gen mới

Viện Genome hợp tác cùng với Bộ Năng Lượng Hoa Kỳ (DOE JGI) là một trong những tổ chức hàng đầu thế giới về giải trình tự bộ gen của vi khuẩn, tập trung vào các ứng dụng tiềm năng của chúng trong lĩnh vực năng lượng sinh học và...

Khác biệt giữa Dự đoán gen và Chú giải gen khi lập bản đồ gen

Mặc dù thuật ngữ ‘Dự đoán gen’ (gene prediction) và ‘Chú giải gene’ (gene annotation) thường được sử dụng giống nhau nhưng thực ra thì chúng khác nhau. Ngoại trừ một số ngoại lệ, các chương trình dự đoán gen (gene predictor) tìm các đoạn trình tự có khả năng...

Ý nghĩa các con số thống kê khi lập bản đồ genome

Bản đồ genome được lập từ các scaffolds và contigs. Contigs là các đoạn trình tự liên tục thu được từ các đoạn reads (đoạn trình tự nhỏ) gối nhau. Scaffolds là tập các contigs được sắp xếp theo trật tự và được nối kết với nhau. (Hình minh họa...

Phương pháp enzyme giải trình tự DNA

Phương pháp enzyme được Sanger và các cộng sự phát minh cũng vào năm 1977, và ngày hôm nay phương pháp này càng ngày càng được hoàn thiện và thực hiện dễ dàng tại các phòng thí nghiệm. Nguyên tắc chung của phương pháp này có thể tóm tắt như...

Phương pháp hóa học giải trình tự DNA

Vào năm 1977, Maxam và Gilbert đã phát minh được một phương pháp hóa học để có thể giải trình tự một đoạn DNA. Nguyên tắc của phương pháp này là: Trước hết là phải đánh dấu một đầu của đoạn DNA cần phải giải trình tự bằng một gốc...

Sách hay: Tin Sinh Học của PGS. TS. Nguyễn Văn Cách

Sách Tin sinh học gồm 10 Chương, 144 trang, xuất bản bởi NXB Khoa học và Kỹ thuật. Các chương gồm Mở đầu Đại cương về internet Cơ sở dữ liệu công nghệ sinh học Nghiên cứu cấu trúc chuối DNA và amino axit Chương trình phân tích cấu trúc...

Sách hay: Bioinformatics – Trends and Methodologies

Đây là cuốn sách được chia sẻ theo giấy phép CC-by bởi nhà xuất bản InTech năm 2011. Giới thiệu sách: Bioinformatics – Trends and Methodologies is a collection of different views on most recent topics and basic concepts in bioinformatics. This book suits young researchers who seek basic fundamentals...