Đánh giá chất lượng lắp ráp hệ phiên mã: những điểm mới và cũ.
Assessing De Novo transcriptome assembly metrics for consistency and utility O’Neil ST1, Emrich SJ. Bối cảnh: Giải trình tự và lắp ráp hệ phiên mã đánh dấu một bước đột phá đem lại lượng tài nguyên dữ liệu rất lớn cho nghiên cứu những loài không phải là loài kiểu...
Phân tích metagenomics dạ cỏ Trâu Ấn Độ – Nguồn tiềm năng lớn cho việc tìm ra các enzyme phân giải sinh khối
High Potential Source for Biomass Degradation Enzyme Discovery and Environmental Aspects Revealed through Metagenomics of Indian Buffalo Rumen Singh KM1, Reddy B2, Patel D2, Patel AK2, Parmar N2, Patel A2, Patel JB3, Joshi CG2 Ý tưởng bài báo cho rằng: Quần thể vi sinh vật tồn tại trong dạ cỏ...
Đánh giá tính khả dụng lâm sàng của dữ liệu genomic và proteomic thu được từ các khối u
Assessing the clinical utility of cancer genomic and proteomic data across tumor types Author: Yuan Yuan, Eliezer M Van Allen, Larsson Omberg, Nikhil Wagle, Ali Amin-Mansour, Artem Sokolov, Lauren A Byers, Yanxun Xu, Kenneth R Hess, Lixia Diao, Leng Han, Xuelin Huang, Michael S Lawrence, John N Weinstein, Josh M...
SAT-Assembler: Bộ công cụ phân tích mở rộng và xác định chính xác mục tiêu cho dữ liệu máy giải trình tự thế hệ mới
Lắp ráp trình tự gen, nhằm ráp lại các đoạn trình tự ngắn hơn lại, là một trong những bước quan trọng trong việc phân tích dữ liệu của máy giải trình tự thế hệ mới. Thiếu bộ gen tham khảo có chất lượng, phân tích De novo sẽ là...
Giải trình tự hoàn thiện lục lạp của 5 loài Araliaceae
Tác giả: Rong Li, Peng-Fei Ma, Jun Wen mail, Ting-Shuang Yi Bối cảnh: Họ Sâm (Araliaceae) có nhiều loài có ý nghĩa kinh tế rất quan trọng. Những nghiên cứu phân loại tiến hóa trước đây xoay quanh ba nhánh chính trong họ Sâm, nhưng mối quan hệ giữa các loài...
Phương pháp phân tích gen và chức năng gen của nấm
Tác giả: Aguilar-Pontes MV, de Vries RP, Zhou M. Cho đến nay, hàng trăm bộ gen nấm đã được giải trình tự và một số lượng lớn vẫn đang được tiến hành. Sự phong phú của thông tin di truyền đã cung cấp những hướng đi mới để nghiên cứu...
Những bằng chứng về gene RIT1 trong hội chứng Noonan
Further evidence of the importance of RIT1 in Noonan syndrome Bertola DR1, Yamamoto GL, Almeida TF, Buscarilli M, Jorge AA, Malaquias AC, Kim CA, Takahashi VN, Passos-Bueno MR, Pereira AC. Tóm tắt: Hội chứng Noonan (NS) là sự rối loạn nhiễm sắc thể thường trội với những triệu chứng như...
Bio.Phylo: Một bộ công cụ thống nhất để xử lý, phân tích và vẽ cây phát sinh loài trong Biopyhon
Tác giả: Eric Talevich, Brandon M Invergo, Peter JA Cock, Brad A Chapman Bối cảnh: Những tiến bộ trong khoa học nghiên cứu tiến hóa và hệ thống phát sinh loài trong sinh học được hỗ trợ song hành cùng với sự phát triển của các công cụ phần mềm, định dạng dữ liệu,...
Phản ứng của hệ động học vi sinh vật đối với sự nhiễm khuẩn của vật chủ
Dynamics of the Microbiota in Response to Host Infection Author(s): Clara Belzer, Georg K. Gerber, Guus Roeselers, Mary Delaney, Andrea DuBois, Qing Liu, Vera Belavusava, Vladimir Yeliseyev, Andres Houseman, Andrew Onderdonk, Colleen Cavanaugh, Lynn Bry Tóm tắt: Các nghiên cứu về vi sinh vật theo dòng thời gian đóng vai trò quan...
Lựa chọn phân loài và chức năng cộng đồng vi sinh vật có mặt trong rễ đậu tương
Taxonomical and functional microbial community selection in soybean rhizosphere. Mendes LW1, Kuramae EE2, Navarrete AA1, van Veen JA3, Tsai SM4. Thí nghiệm này đề cập đến sự chọn lọc quần thể vi sinh vật trong vùng rễ của đậu tương có mặt phần lớn ở vùng đất trồng đậu tương...