Cải thiện khả năng dự đoán gen trên hệ gen chuột bằng cách kết hợp EST với thông tin trình tự RNA
Tác giả: Li L1, Chen E2, Yang C3, Zhu J4, Jayaraman P5, De Pons J5, Kaczorowski CC3, Jacob HJ6, Greene A3, Hodges MR3, Cowley AW Jr3, Liang M3, Xu H7, Liu P8, Lu Y9. RNA–seq (còn gọi là trình tự transcriptome) là một công nghệ đang phát triển sử dụng...
“Gene thông minh” chưa hẳn đã thông minh
Việc các nhà khoa học đang tìm kiếm những gene có ảnh hưởng đến trí tuệ trên thực tế rất gian nan. Một trong những nghiên cứu lớn và nghiêm túc nhất về cơ sở di truyền của trí tuệ loài người cũng mới chỉ đưa ra được một vài...
Giải trình tự và phân tích gen lợn Mangalica – giống lợn béo đặc trưng ở Hungary
Tác giả: Molnár J, Nagy T, Stéger V, Tóth G, Marincs F1, Barta E. Mangalicas là loài lợn béo và quý hiếm đặc trưng của Hungary. Để hiểu rõ đặc tính di truyền, chúng tôi chọn ra từ mỗi giống lợn Mangalica một con lợn đực (lợn Mangalica có ba...
RNA-Rocket: Nguồn tài nguyên cho phân tích RNA-seq trong nghiên cứu bệnh lây nhiễm
RNA-seq là phương pháp sàng lọc hệ phiên mã sử dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới và là một trong những nhân tố quan trọng trong rất nhiều dự án nghiên cứu mong muốn khám phá các transcripts isoform, sàng lọc biểu hiện hay cấu trúc phiên...
Tích hợp các biến đổi di truyền phổ biến và biến đổi di truyền hiếm ở các nhóm người khác nhau
Mặc dù đã có những tiến bộ lớn trong việc xác định các biến đổi di truyền ảnh hưởng đến bệnh ở người, tuy nhiên, hầu hết bệnh liên quan đến di truyền vẫn chưa thể giải thích. Cần phải thực hiện những nghiên cứu trên toàn bộ hệ gen...
Phân tích phát sinh loài và so sánh trình tự của vi khuẩn sinh Alpha Amylase bền nhiệt thuộc các giới Archea, Prokaryotes và Eukaryotes
Tác giả: Huma T1, Maryam A1, Rehman SU2, Qamar MT1, Shaheen T1, Haque A1, Shaheen B1 Alpha amylase nói chung được định nghĩa là nhóm enzyme có khả năng thủy phân liên kết alpha của các polysaccharide. Để phân tích và so sánh các nhóm alpha amylase, trình tự nucleotide...
Giải trình tự thế hệ mới phải bị loại bỏ (phần 3) – câu chuyện về tiêu đề
Tiếp tục loại bài viết về cách sử dụng thuật ngữ “giải trình tự thế hệ mới” (NGS). Trong buổi sáng hôm nay, tôi xin đưa ra so sánh 2 bài báo: De Novo Assembly and Annotation of Salvia splendens Transcriptome Using the Illumina Platform — Ge et al. PLOS ONE RepARK—de...
Giới thiệu Biopython – Ngôn ngữ của Tin Sinh học
1 Biopython là gì? Dự án Biopython là 1 tổ chức quốc tế của những lập trình viên sử dụng công cụ Python (http://www.python.org) trong lĩnh vực sinh học phân tử. Python là một ngôn ngữ lập trình hướng đối tượng, thông dịch, và linh hoạt nên đã trở nên...
Tốc độ chóng mặt của việc đánh mất dữ liệu trong khoa học
Trên những căn gác mái, trong thùng carton vương vãi trong garage hay những chiếc đĩa mềm đã không còn được sử dụng từ lâu – đây chỉ là một số trong những nơi các nhà nghiên cứu thừa nhận đã dùng để lưu trữ các dữ liệu cũ. Điều...
Phần mềm miễn phí trong tin sinh học
Phần mềm miễn phí là gì? Khi Linus Torvalds và Richard M.Stallman phát triển nhân Linux và dự án GNU, có lẽ họ cũng không lường trước được tầm quan trọng của công việc mình làm. Hệ điều hành GNU/Linux được tạo ra năm 1992 bằng cách kết hợp hai...
