Lựa chọn marker cho các nghiên cứu về di truyền
Việc kết hợp các nghiên cứu có thể chú trọng đến các gen tiềm năng, một vùng di truyền cụ thể hay toàn bộ hệ gen… chúng đều có ý nghĩa trong việc lựa chọn marker. Lựa chọn marker cơ chiến lược sẽ có ảnh hưởng lớn đến các nghiên...
Phân tích hệ phiên mã cơ xương của người
Cơ xương của chúng ta có ảnh hưởng trực tiếp đến rất nhiều bệnh như tiểu đường tuýp 2, bệnh tim và cả ung thư. Cơ xương là một trong nhưng mô được sử dụng rộng rãi nhất để nghiên cứu những cơ chế gây bệnh khác nhau. Với những...
Cải thiện khả năng dự đoán gen trên hệ gen chuột bằng cách kết hợp EST với thông tin trình tự RNA
Tác giả: Li L1, Chen E2, Yang C3, Zhu J4, Jayaraman P5, De Pons J5, Kaczorowski CC3, Jacob HJ6, Greene A3, Hodges MR3, Cowley AW Jr3, Liang M3, Xu H7, Liu P8, Lu Y9. RNA–seq (còn gọi là trình tự transcriptome) là một công nghệ đang phát triển sử dụng...
“Gene thông minh” chưa hẳn đã thông minh
Việc các nhà khoa học đang tìm kiếm những gene có ảnh hưởng đến trí tuệ trên thực tế rất gian nan. Một trong những nghiên cứu lớn và nghiêm túc nhất về cơ sở di truyền của trí tuệ loài người cũng mới chỉ đưa ra được một vài...
Giải trình tự và phân tích gen lợn Mangalica – giống lợn béo đặc trưng ở Hungary
Tác giả: Molnár J, Nagy T, Stéger V, Tóth G, Marincs F1, Barta E. Mangalicas là loài lợn béo và quý hiếm đặc trưng của Hungary. Để hiểu rõ đặc tính di truyền, chúng tôi chọn ra từ mỗi giống lợn Mangalica một con lợn đực (lợn Mangalica có ba...
RNA-Rocket: Nguồn tài nguyên cho phân tích RNA-seq trong nghiên cứu bệnh lây nhiễm
RNA-seq là phương pháp sàng lọc hệ phiên mã sử dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới và là một trong những nhân tố quan trọng trong rất nhiều dự án nghiên cứu mong muốn khám phá các transcripts isoform, sàng lọc biểu hiện hay cấu trúc phiên...
Tích hợp các biến đổi di truyền phổ biến và biến đổi di truyền hiếm ở các nhóm người khác nhau
Mặc dù đã có những tiến bộ lớn trong việc xác định các biến đổi di truyền ảnh hưởng đến bệnh ở người, tuy nhiên, hầu hết bệnh liên quan đến di truyền vẫn chưa thể giải thích. Cần phải thực hiện những nghiên cứu trên toàn bộ hệ gen...
Phân tích phát sinh loài và so sánh trình tự của vi khuẩn sinh Alpha Amylase bền nhiệt thuộc các giới Archea, Prokaryotes và Eukaryotes
Tác giả: Huma T1, Maryam A1, Rehman SU2, Qamar MT1, Shaheen T1, Haque A1, Shaheen B1 Alpha amylase nói chung được định nghĩa là nhóm enzyme có khả năng thủy phân liên kết alpha của các polysaccharide. Để phân tích và so sánh các nhóm alpha amylase, trình tự nucleotide...
Giải trình tự thế hệ mới phải bị loại bỏ (phần 3) – câu chuyện về tiêu đề
Tiếp tục loại bài viết về cách sử dụng thuật ngữ “giải trình tự thế hệ mới” (NGS). Trong buổi sáng hôm nay, tôi xin đưa ra so sánh 2 bài báo: De Novo Assembly and Annotation of Salvia splendens Transcriptome Using the Illumina Platform — Ge et al. PLOS ONE RepARK—de...
Giới thiệu Biopython – Ngôn ngữ của Tin Sinh học
1 Biopython là gì? Dự án Biopython là 1 tổ chức quốc tế của những lập trình viên sử dụng công cụ Python (http://www.python.org) trong lĩnh vực sinh học phân tử. Python là một ngôn ngữ lập trình hướng đối tượng, thông dịch, và linh hoạt nên đã trở nên...
