Tin sinh học: Chưa khai thác hết tiềm năng
Sự kết hợp giữa khoa học tính toán và công nghệ sinh học nhằm giải thích những cơ chế của sự sống đã mở ra một lĩnh vực nghiên cứu mới, Tin sinh học (Bioinformatics). Bắt nhịp xu thế phát triển này của khoa học thế giới, các nhà Tin...
Từ dữ liệu RNA-seq khám phá ra thời gian biểu ăn uống ảnh hưởng lớn tới sức khỏe
Theo một nghiên cứu mới nhất từ Đại học San Diego State (SDSU) thì thời gian biểu cho các bữa ăn có vai trò quan trọng không kém việc lựa chọn khẩu phần ăn phù hợp. Nghiên cứu mới này được công bố gần đây bởi các nhà khoa học...
Máy bán DNA tự động
Máy bán hàng tự động bán nước ngọt, kẹo và khoai tây chiên đã không còn gì xa lạ với chúng ta. Nhưng đối với Fellow Gabe Barcia-Colombo thì khác, nghệ sĩ này đã tưởng tượng ra một máy bán DNA tự động, DNA được tách chiết từ con người,...
SortMeRNA: Công cụ phát hiện rRNA trong dữ liệu transcriptome RNA-seq
Mục tiêu: Việc áp dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS) vào các dự án RNA-seq đã đặt ra một bài toán khó giải cho các nhóm nghiên cứu rằng: tách chiết RNA tổng số có bị lẫn ribosomal RNA (rRNA) hay không? Sàng lọc được coding...
Tổng quan về chú giải chức năng cho dữ liệu RNA-seq
Tính ứng dụng và tiện lợi từ việc tạo ra dữ liệu RNA-seq đã thúc đẩy những hướng nghiên cứu về chú giải chức năng trong những năm gần đây. Mặc dù vậy, những phân tích về RNA-seq mới chỉ đưa ra một danh sách gen riêng biệt (differentially expressed...
Công cụ tin sinh học cho phân tích metagenome
Các nhà khoa học tại Los Alamos National Laboratory đã phát triển một phương pháp phân tích DNA của một quần thể vi sinh vật như quần thể vi sinh vật ở biển, đất và trong đường ruột chúng ta. “Metagenomic nghiên cứu toàn bộ quần thể vi sinh vật...
Giới thiệu về GATK (Genome Analysis Toolkit) – công cụ tìm kiếm SNPs trong giải trình tự gene thế hệ mới (NGS)
GATK là gì? Theo đúng tên gọi của nó, GATK là tập hợp các công cụ phân tích bộ genome. GATK sẽ cho phép bạn xác định tìm SNPs, InDels, xác định các đột biến hiếm gặp, cũng như những đột biến nào là đặc trưng cho một nhóm bệnh...
Nghiên cứu cho thấy gen tác động đến xu hướng tình dục ở nam giới
Một nghiên cứu trên những người đàn ông đồng tính ở Mỹ đã tìm thấy bằng chứng chứng minh rằng xu hướng tình dục của nam giới có bị tác động bởi gen. Các nhà khoa học đã lấy mẫu DNA của 400 người đàn ông đồng tính và thấy...
Th3
Sự tái bắt cặp những read không sắp xếp được dựa vào điểm chất lượng.
Tóm tăt Nguyên nhân: Dựa vào công nghệ giải trình tự thế hệ mới, một loạt những ứng dụng trong sinh học đã được phát triển, trong đó sự bắt cặp trình tự (alignment) là bước đầu khi thu được các read giải trình tự. Những năm gần đây, nhiều...
Mô hình hóa cấu trúc protein của gen và hệ gen
Phương pháp so sánh mô hình (Comparative modelling) là một phương pháp dự đoán cấu trúc ba chiều của một chuỗi amino acid (protein) dựa vào sự liên kết của nó với một hoặc một vài cấu trúc protein đã sẵn có.Quá trình dự đoán bao gồm xác định dạng...
