Chọn lọc đặc điểm và phân loại protein trong tin sinh học
Efficient feature selection and classification of protein sequence data in bioinformatics. Iqbal MJ, Faye I, Samir BB, Md Said A. Tin sinh học là một lĩnh vực nghiên cứu mới trong khoảng 30 năm trở lại đây. Mục đích của tin sinh học là lưu trữ, quản lý dữ liệu...
Lắp ráp de novo hệ phiên mã Themira biloba (Sepsidae: Diptera) sử dụng k-mer có độ dài khác nhau
A pipeline for the de novo assembly of the Themira biloba (Sepsidae: Diptera) transcriptome using a multiple k-mer length approach Melicher D1, Torson AS, Dworkin I, Bowsher JH. Bối cảnh: Họ ruồi Sepsidae là hình mẫu lý tưởng để nghiên cứu chọn lọc giới tính cũng như hiện tượng lưỡng...
Di truyền trong nghiên cứu ung thư: Vùng DNA không mã hóa đã được giải mã
Ung thư là một căn bệnh liên quan đến bộ gen, là kết quả của sự kết hợp nhiều đột biến gen. Chúng ta thừa hưởng nhiều bẩm chất dù mạnh hay yếu từ cha mẹ dẫn đến nhiều loại ung thư khác nhau; thêm vào đó, chúng ta cũng...
MolabIS – Hệ thống tích hợp thông tin để lưu trữ và quản lý dữ liệu di truyền phân tử
MolabIS – An integrated information system for storing and managing molecular genetics data Author: Cong VC Truong, Linn F Groeneveld, Burkhard Morgenstern and Eildert Groeneveld Bối cảnh: Lưu trữ, theo dõi lâu dài lưu lượng và việc truy cập dữ liệu để thực hiện các phân tích sâu hơn đóng vai trò rất quan trọng...
Phát hiện gen kháng kháng sinh có trong vật nuôi lấy thịt
Một bài tổng quan mới đây của Heather K Allen được đăng trên tạp chí Current Opinion in Microbiology năm 2014 đã cho rằng: những môi trường có chứa nhiều mầm bệnh sẽ làm cho vấn đề kháng kháng sinh ở một số bệnh của người ngày một lan rộng....
Kéo dãn DNA: kỹ thuật mới để phát hiện bệnh
Các nhà khoa học làm cho sợi DNA xuyên qua bảng nanochannel mỏng hơn 1000 lần so với một sợi tóc. Đây là một kỹ thuật mới, gọi là kéo dãn DNA, và là một trong những hướng nghiên cứu mà CIC microGUNE đang làm, khi họ publish 2 bài...
So sánh một số công cụ lắp ráp de novo cho dữ liệu từ thiết bị giải trình tự thế hệ mới
Comparative studies of de novo assembly tools for next-generation sequencing technologies. Author: Lin Y1, Li J, Shen H, Zhang L, Papasian CJ, Deng HW. Ngày nay, một vài công cụ lắp ráp de novo đã được phát triển để sử dụng các đoạn trình tự ngắn được tạo ra từ...
Giải trình tự phác thảo bộ gene (Draft genome sequence) của Mycobacterium neoaurum dòng DSM 44074T
Mycobacterium neoaurum là một loài vi khuẩn ngoài môi trường và sinh trưởng nhanh thuộc chi Mycobacterium. Có một số ghi chép về chúng là nguyên nhân gây bệnh khi nhiễm vào máu, da, phổi ở những bệnh nhân bị suy giảm hệ thống miễn dịch. Để hoàn thiện bộ...
Tổng hợp: Các tài nguyên tin sinh học sử dụng trong nghiên cứu SNP
SNP bioinformatics: a comprehensive review of resources Author: Andrew D. Johnson Giới thiệu: Những năm gần đây chứng kiến sự tăng lên theo hàm mũ của các nghiên cứu và phát hiện mới về genetic và genomic variation do ngày càng có nhiều genome được giải trình tự hoàn chỉnh, đi...
EBI metagenomic một giải pháp cho lưu trữ và phân tích dữ liệu metagenomic
Metagenomic là lĩnh vực sử dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới được dùng để đánh giá đặc điểm của quần thể vi sinh vật ở các hệ sinh thái khác nhau như biển, hồ, đất, trong cơ thể người vv. Tuy nhiên ứng dụng metagenomic cũng gặp...
