Phân tích mẫu giải trình tự 16S rRNA từ môi trường sử dụng MEGAN
Analysis of 16S rRNA environmental sequences using MEGAN Suparna Mitra*, Mario Stärk, Daniel H Huson From Asia Pacific Bioinformatics Network (APBioNet) Tenth International Conference on Bioinformatics–First ISCB Asia Joint Conference 2011 (InCoB/ISCB-Asia 2011) Tóm lược Bối cảnh: Metagenomics là một lĩnh vực đang phát triển rất mạnh mẽ với hi...
Đặc Điểm Phân Tử của Các Chủng Vi Khuẩn Lao Kháng Thuốc Rifamin và Isoniazid Được Phân Lập Tại Việt Nam
Molecular Characteristics of Rifampin- and Isoniazid-Resistant Mycobacterium tuberculosisStrains Isolated in Vietnam Minh NN, Van Bac N, Son NT, Lien VT, Ha CH, Cuong NH, Mai CT, Le TH. Institute of Biotechnology, Vietnam Academy of Science and Technology, Hospital 103, Vietnam Military Medical University, Vietnam. nghiemminh@ibt.ac.vn Tóm lược...
Lắp ráp de novo hệ phiên mã mô sinh dục của ốc sên biển Reishia clavigera
Reishia clavigera (thường được biết tới với Thais clavigera), một loài ốc sên biển hay sống ở các bãi triều là một trong những loài rất nhạy cảm với organotin gây nên rối loạn sinh dục. Mặc dù vậy, thông tin hệ phiên mã (mRNA-transcriptome) của loài này vẫn còn...
Phát hiện và phân tích đa hình nucleotit (SNPs) bằng công cụ Tin sinh học
Bioinformatics Tools for Single Nucleotide Polymorphism Discovery and Analysis Clifford RJ, Edmonson MN, Nguyen C, Scherpbier T, Hu Y, Buetow KH Tóm lược Xác định các thay đổi của một nucleotit (Single nucleotied polymorphisms – SNPs) vô cùng có ý nghĩa trong nghiên cứu cơ sở di truyền của bệnh....
Phân tích so sánh hệ gene của các chủng vi khuẩn lao kháng thuốc ở Nga
Original title: Comparative Genomic Analysis of Mycobacterium tuberculosis Drug Resistant Strains from Russia Authors: Elena N. Ilina, Egor A. Shitikov, Larisa N. Ikryannikova, Dmitry G. Alekseev, Dmitri E. Kamashev, Maja V. Malakhova, Tatjana V. Parfenova, Maxim V. Afanas’ev, Dmitry S. Ischenko, Nikolai A. Bazaleev, Tatjana G. Smirnova, Elena E. Larionova,...
Phát hiện cơ chế sinh ra gen mới qua 40.000 thế hệ E. coli
Bài báo http://europepmc.org/articles/PMC3461117 công bố năm 2012 mô tả những thí nghiệm mà nhà khoa học Richard E. Lenski đã thực hiện trong suốt 20 năm qua: Ông đã nuôi cấy 12 mẫu vi khuẩn E. coli qua 40.000 thế hệ trên môi trường thiếu đường glucose, giàu muối citrate và bảo quản...
Quy trình xác định đột biến hệ gen
Hiện nay, Chúng tôi đã cài đặt, thử nghiệm thành công quy trình phân tích, xác định và đánh giá đột biến gen SNP/INDEL từ dữ liệu đọc trình tự thế hệ mới với các thiết bị đọc trình tự khác nhau như Illumina MiSeq/HiSeq, ionTorrent PGM, với các giai...
Phân tích đột biến trên gen ABL1
Ở phân tích này, chúng tôi tiến hành xác định đột biến trên gen ABL1 của các bệnh nhân. Dữ liệu trình tự gene ABL1 từ mẫu bệnh phẩm thu được từ thiét bị đọc trình tự gen thế hệ mới Illumina MiSeq với độ sâu rất lớn (trên 200KX)....
Xác định đột biến SNP/Variant của hệ gen vi khuẩn lao Việt Nam
Hệ gen vi khuẩn lao thu được từ bệnh phẩm tại bệnh viện Lao đã được giải trình tự bằng thiết bị đọc trình tự thế hệ mới Illumina Miseq. Từ dữ liệu trình tự hệ gen vi khuẩn lao đó, chúng tôi tiến hành so sánh với các hệ...
Phát hiện ung thư bằng cách xét nghiệm đột biến gene
Ngày 10/10, Bệnh viện Ung bướu Hà Nội chính thức khai trương đơn vị xét nghiệm gene – áp dụng kỹ thuật tiên tiến nhất thế giới hiện nay về công nghệ sinh học trong chẩn đoán và điều trị ung thư. Đây là BV đầu tiên của ngành Y...
