MP3 – công cụ dự đoán protein gây bệnh từ dữ liệu genomic và metagenomic
MP3: A Software Tool for the Prediction of Pathogenic Proteins in Genomic and Metagenomic Data. Author: Gupta A, Kapil R, Dhakan DB, Sharma VK Xác định các protein có hại từ các bộ trình tự de novo rất hữu ích cho việc dự đoán và tìm hiểu cơ chế gây...
So sánh hai công cụ phân tích dữ liệu metagenomic: MR-RAST và QIIME
Trong những năm gần đây, thiết bị giải trình tự thế hệ mới (NGS) cùng với sự phát triển của phương pháp metagenomic đã cách mạng hóa lĩnh vực nghiên cứu hệ sinh thái vi sinh vật. Lượng dữ liệu metagenomic được tạo ra ngày càng lớn kéo theo sự...
Tuyển thực tập sinh
Phòng Tin sinh học, Viện Công nghệ sinh học, Viện Hàn Lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam THÔNG BÁO TUYỂN THỰC TẬP SINH Phòng Tin sinh học (LoBi), viện Công nghệ sinh học hiện luôn tuyển sinh viên thực tập tham gia các dự án Tin sinh học do phòng...
Phân tích mẫu giải trình tự 16S rRNA từ môi trường sử dụng MEGAN
Analysis of 16S rRNA environmental sequences using MEGAN Suparna Mitra*, Mario Stärk, Daniel H Huson From Asia Pacific Bioinformatics Network (APBioNet) Tenth International Conference on Bioinformatics–First ISCB Asia Joint Conference 2011 (InCoB/ISCB-Asia 2011) Tóm lược Bối cảnh: Metagenomics là một lĩnh vực đang phát triển rất mạnh mẽ với hi...
Đặc Điểm Phân Tử của Các Chủng Vi Khuẩn Lao Kháng Thuốc Rifamin và Isoniazid Được Phân Lập Tại Việt Nam
Molecular Characteristics of Rifampin- and Isoniazid-Resistant Mycobacterium tuberculosisStrains Isolated in Vietnam Minh NN, Van Bac N, Son NT, Lien VT, Ha CH, Cuong NH, Mai CT, Le TH. Institute of Biotechnology, Vietnam Academy of Science and Technology, Hospital 103, Vietnam Military Medical University, Vietnam. nghiemminh@ibt.ac.vn Tóm lược...
Lắp ráp de novo hệ phiên mã mô sinh dục của ốc sên biển Reishia clavigera
Reishia clavigera (thường được biết tới với Thais clavigera), một loài ốc sên biển hay sống ở các bãi triều là một trong những loài rất nhạy cảm với organotin gây nên rối loạn sinh dục. Mặc dù vậy, thông tin hệ phiên mã (mRNA-transcriptome) của loài này vẫn còn...
Phát hiện và phân tích đa hình nucleotit (SNPs) bằng công cụ Tin sinh học
Bioinformatics Tools for Single Nucleotide Polymorphism Discovery and Analysis Clifford RJ, Edmonson MN, Nguyen C, Scherpbier T, Hu Y, Buetow KH Tóm lược Xác định các thay đổi của một nucleotit (Single nucleotied polymorphisms – SNPs) vô cùng có ý nghĩa trong nghiên cứu cơ sở di truyền của bệnh....
Phân tích so sánh hệ gene của các chủng vi khuẩn lao kháng thuốc ở Nga
Original title: Comparative Genomic Analysis of Mycobacterium tuberculosis Drug Resistant Strains from Russia Authors: Elena N. Ilina, Egor A. Shitikov, Larisa N. Ikryannikova, Dmitry G. Alekseev, Dmitri E. Kamashev, Maja V. Malakhova, Tatjana V. Parfenova, Maxim V. Afanas’ev, Dmitry S. Ischenko, Nikolai A. Bazaleev, Tatjana G. Smirnova, Elena E. Larionova,...
Phát hiện cơ chế sinh ra gen mới qua 40.000 thế hệ E. coli
Bài báo http://europepmc.org/articles/PMC3461117 công bố năm 2012 mô tả những thí nghiệm mà nhà khoa học Richard E. Lenski đã thực hiện trong suốt 20 năm qua: Ông đã nuôi cấy 12 mẫu vi khuẩn E. coli qua 40.000 thế hệ trên môi trường thiếu đường glucose, giàu muối citrate và bảo quản...
Quy trình xác định đột biến hệ gen
Hiện nay, Chúng tôi đã cài đặt, thử nghiệm thành công quy trình phân tích, xác định và đánh giá đột biến gen SNP/INDEL từ dữ liệu đọc trình tự thế hệ mới với các thiết bị đọc trình tự khác nhau như Illumina MiSeq/HiSeq, ionTorrent PGM, với các giai...
