Các nhà nghiên cứu thành lập bộ tiêu chuẩn về kiểu gene của con người đối với việc giải trình tự hệ gene
Hướng dẫn bởi kỹ sư y sinh Justin Zook của viện tiêu chuẩn và công nghệ (National Institute of Standards and Technology) , một nhóm các nhà khoa học từ đại học Harvard và viện tin sinh học Virginia (Virginia Bioinformatics Institute of Virginia Tech) giới thiệu một số phương...
Skewer: Công cụ cắt adapter nhanh và chính xác cho dữ liệu pair-end giải trình tự thế hệ mới
Skewer: a fast and accurate adapter trimmer for next-generation sequencing paired-end reads. Jiang H1, Lei R, Ding SW, Zhu S Bối cảnh: Cắt adapter là bước đầu tiên và rất quan trọng trong xử lý dữ liệu giải trình tự thế hệ mới với độ dài trình tự đọc (reads)...
Nghiên cứu hệ gen của lợn bằng Quick SNP
Với sự phát triển nhanh chóng của công nghệ trong những năm gần đây, con người có thể tác động đến genome lợn ở mức độ base pair. Những hiểu biết này dễ dẫn đến quan niệm rằng những con lợn trên thế giới giống hệt nhau nếu có cùng...
Liệu chúng ta có thể dùng vi sinh vật thay thế cho các tế bào T và cytokine trong điều trị bệnh viêm đường ruột
Một điều rõ ràng rằng vi khuẩn đường ruột (có liên quan) đến nhiều khía cạnh của bệnh viêm đường ruột (IBD) và nhờ vào việc hiểu thêm về nguyên nhân từ vi khuẩn đó dẫn đến bệnh có thể hé mở ra những cơ hội mới để có thể...
Xét nghiệm gen cho bệnh tim
Đại học Y khoa Washington ở St Louis vừa đưa ra một xét nghiệm di truyền giúp chẩn đoán và điều trị bệnh nhân bị rối loạn tim mạch có thể dẫn đến đột tử. Xét nghiệm mới này – được cung cấp bởi trường Dịch Vụ Di Truyền và...
Metagenomics – Đây liệu đã là điểm dừng?
METAGENOMICS Đây liệu đã là điểm dừng? Trong sinh học, 3 stop codon được cho rằng kết thúc sự dịch mã là TAG (còn gọi là amber), TGA (còn gọi là opal) và TAA (còn gọi là ochre). Trong một nghiên cứu, Ivanova và các đồng tác giả đã phân...
Tổng hợp các công cụ Tin Sinh học dùng trong phân tích metagenomics
Khác với dữ liệu genome, dữ liệu metagenome thu được từ công nghệ giải trình tự thế hệ mới lớn hơn, có độ bao phủ thấp hơn và thường không dư thừa thông tin, dẫn đến thời gian phân tích và tỉ lệ lỗi cao hơn nếu sử dụng các...
PhyloSift: Phân tích phát sinh loài từ dữ liệu genomic và metagenomic
PhyloSift: Phân tích phát sinh loài từ dữ liệu genomic và metagenomic Author: Aaron E. Darling, Guillaume Jospin, Eric Lowe,Frederick A. Matsen, Holly M. Bik, and Jonathan A. Eisen. Giống như những sinh vật khác, vi sinh vật trong môi trường cũng có những tác động đến quá trình tiến...
Epigenome: DNA Không Là Định Mệnh
Y khoa cũng như khoa học nói chung càng ngày càng đem đến những chuyện khó tin nhưng có thật. Hai khoa học gia Michael Meaney và Moshe Szyf của McGill University, Canada nghiên cứu về tác dụng của sự triù mến của con chuột mẹ trên tương lai con...
So Sánh Các Phương Pháp Phân Loại Trình Tự 16S rRNA Thành OTU
A Comparison Of Methods For Clustering 16S rRNA Sequences Into Otus Wei Chen, Clarence K. Zhang, Yongmei Cheng, Shaowu Zhang, Hongyu Zhao mail Tóm tắt Các nghiên cứu gần đây về 16S rRNA ứng dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới đã giúp chúng ta hiểu sâu hơn...
