RNAseq (RNA sequencing) là phương pháp phân tích toàn bộ các loại RNA có trong một mẫu bằng cách sử dụng kỹ thuật sequencing. Kỹ thuật này cho phép xác định chuỗi nucleotide của các phân tử RNA trong mẫu, từ đó có thể phân tích biểu hiện gen, tìm kiếm các biến thể gen, phát hiện tế bào ung thư và các bệnh liên quan đến sự thay đổi gen, và nghiên cứu cấu trúc của các loại RNA khác nhau.
Tổng quan về chú giải chức năng cho dữ liệu RNA-seq
Tính ứng dụng và tiện lợi từ việc tạo ra dữ liệu RNA-seq đã thúc đẩy những hướng nghiên cứu về chú giải chức năng trong những năm gần đây. Mặc dù vậy, những phân tích về RNA-seq mới chỉ đưa ra một danh sách gen riêng biệt (differentially expressed...
Phát hiện virus thực vật trong tự nhiên nhờ RNA-seq
Giải trình tự RNA bằng các máy giải trình tự thế hệ mới đang là bước làm đột phá trong nghiên cứu virus. Bên cạnh việc phát hiện rất nhiều chủng virus có trong các cậy dại ở môi trường tự nhiên, RNA-seq cũng cho phép thu thập cả dữ...
Dữ liệu Rna-seq: Thách thức và những gợi ý cho thiết kế thí nghiệm và phân tích
RNA-seq dường như đã trở thành phương pháp rất phổ biến trong phân tích biểu hiện gen cũng như phát hiện những transcript mới, xác định biểu hiện trên alen đặc hiệu hay có thể ước lượng chính xác sự dịch mã của transcript. Thiết kế thí nghiệm chặt chẽ...
Cải thiện khả năng dự đoán gen trên hệ gen chuột bằng cách kết hợp EST với thông tin trình tự RNA
Tác giả: Li L1, Chen E2, Yang C3, Zhu J4, Jayaraman P5, De Pons J5, Kaczorowski CC3, Jacob HJ6, Greene A3, Hodges MR3, Cowley AW Jr3, Liang M3, Xu H7, Liu P8, Lu Y9. RNA–seq (còn gọi là trình tự transcriptome) là một công nghệ đang phát triển sử dụng...
RNA-Rocket: Nguồn tài nguyên cho phân tích RNA-seq trong nghiên cứu bệnh lây nhiễm
RNA-seq là phương pháp sàng lọc hệ phiên mã sử dụng công nghệ giải trình tự thế hệ mới và là một trong những nhân tố quan trọng trong rất nhiều dự án nghiên cứu mong muốn khám phá các transcripts isoform, sàng lọc biểu hiện hay cấu trúc phiên...
Th9
PRADA: Quy trình phân tích dữ liệu RNA-seq
PRADA: pipeline for RNA sequencing data analysis. Torres-García W, Zheng S, Sivachenko A, Vegesna R, Wang Q, Yao R, Berger MF, Weinstein JN, Getz G, Verhaak RG. Tóm tắt: Công nghệ giải trình tự hiệu năng cao ngày càng phát triển đòi hỏi các công cụ phần mềm đi kèm...
Th8
- 1
- 2
