Yêu cầu chất lượng và quy cách đóng gói mẫu để thực hiện giải trình tự NGS/Sanger

Yêu cầu chất lượng mẫu Để kiểm tra chất lượng, mẫu cần được điện di trên gel + đo nồng độ và độ tinh sạch. Các yêu cầu cụ thể của từng loại mẫu cần đáp ứng như sau: Mẫu đọc whole genome Mẫu đọc 16S/18S/ITS Mẫu đọc Sanger Mẫu...

FAQ | Giải trình tự toàn bộ hệ gen – WGS

Sự khác nhau giữa resequencing, de novo sequencing và lắp ráp hệ gen (genome assembly) là gì? Resequencing thường được lựa chọn khi trình tự hệ gen tham chiếu của loài đã được công bố. Các read được dóng hàng với hệ gen tham chiếu để xác định vị trí...

Tổng kết Webinar 01 | Metagenomics: xu thế, thuận lợi và khó khăn

Ngày 16 tháng 4 năm 2022, LOBI Việt Nam đã tổ chức thành công Webinar 01 với chủ đề Metagenomics: xu thế, thuận lợi và khó khăn do NCS. Phạm Quang Huy trình bày. Webinar đã thu hút được hơn 200 lượt đăng ký tham dự, với đối tượng người...

Webinar 01 | Metagenomics: xu thế, thuận lợi và khó khăn

Những nghiên cứu về hệ vi sinh vật đã bùng nổ mạnh mẽ trong khoảng hơn 10 năm gần đây 2010-2022, dẫn đến một loạt các phương pháp thực nghiệm, giải trình tự, công cụ tin sinh cũng như các thuật toán được phát triển và áp dụng nhằm trả...

Các câu hỏi thường gặp về xét nghiệm di truyền

Xét nghiệm di truyền là gì?  Xét nghiệm di truyền (genetic testing) là một loại xét nghiệm y tế xác định những thay đổi trong gen, nhiễm sắc thể hoặc protein. Kết quả của xét nghiệm di truyền có thể xác nhận hoặc loại trừ tình trạng di truyền nghi...

1 Comment

Lựa chọn microarray cho nghiên cứu và chẩn đoán lâm sàng

Giới thiệu Công nghệ microarray giúp xác định các đột biến đơn nucleotide (SNV) được sử dụng rộng rãi trong các nghiên cứu tương quan toàn bộ hệ gen (GWAS) và chẩn đoán, xét nghiệm lâm sàng. Các trung tâm chăm sóc sức khỏe trên thế giới đã và đang...

Giải trình tự Epigenomics (Phân tích DNA Methylation)

(Nguồn ảnh) Di truyền học biểu sinh hay còn gọi là Ngoại di truyền học là ngành sinh học xem xét sự thay đổi trong chức năng gen không bị gây ra bởi đột biến (không có sự thay đổi nào trong chuỗi DNA của bộ gene) và di truyền cho...

Giải trình tự thế hệ mới trong chọn giống thực vật – MutMap

Việc xác định các gen/đột biến liên quan đến một tính trạng cụ thể và lập bản đồ liên kết, tìm kiếm các chỉ thị phân tử liên quan có vai trò quan trọng trong di truyền và chọn giống thực vật. Mapping gen với tính trạng là bài toán...

Phân tích metagenomics: 16S, 18S, ITS hay shotgun?

Phân tích metagenomics là một công cụ mạnh mẽ để phân tích đa dạng vi sinh vật trong môi trường một cách nhanh chóng, đặc biệt phù hợp để phân tích những loài vi sinh vật không thể phân lập hoặc nuôi cấy (Xem Tổng quan metagenomics). LOBI cung cấp...

1 Comment

Tổng quan về giải trình tự DNA

Giải trình tự DNA (DNA sequencing) là kỹ thuật được sử dụng để xác định trình tự nucleotide của DNA. Các phân tử DNA được tạo nên bởi bốn loại nucleotide A, T, G, C. Trình tự nucleotide là bản thiết kế có chứa các thông tin hướng dẫn để...